Onderzoeker
Katleen De Preter
- Trefwoorden:computationele deconvolutie, biomerker studies, genomica, vloeibare biopten, 'single' cel analyse, DNA en RNA sequenering, bioinformatica
- Disciplines:Genomics, Medische metagenomics, Medische genomics, Medische epigenomics, Kankerdiagnose, Kankerbiologie, Moleculaire diagnostiek
Affiliaties
- Vakgroep Biomoleculaire Geneeskunde (Departement)
Lid
Vanaf1 okt 2018 → Heden - Vakgroep Pediatrie en genetica (Departement)
Lid
Vanaf1 okt 2000 → 30 sep 2018
Projecten
1 - 10 of 23
- SpatialConnect: het connecteren van weefselbiologie met de spatiale genexpressie per individuele celVanaf1 mei 2022 → HedenFinanciering: FWO Middelzware apparatuur
- Replicatievork protectiefactoren als nieuwe doelwitten voor ombinatietherapie en immunomodulering (REINFORCE)Vanaf1 jan 2022 → HedenFinanciering: BOF - projecten
- DNA methylatie in Common Variable Immunodeficiencies (CVID): een gedetailleerde studie naar DNA methylatie heterogeniteit en relatie met ziekte klassificatieVanaf1 nov 2021 → HedenFinanciering: FWO mandaten
- Predictie van immuuntherapie response en toxiciteit in melanoom, nier- en longkanker door een transcriptoom gebaseerde immuun profilering.Vanaf1 nov 2021 → HedenFinanciering: FWO mandaten
- Ontwikkeling van een minimaal-invasieve test voor accurate diagnose van CUP ("Cancer of Unknown primary") door bepaling van het DNA methylatie profielVanaf1 okt 2021 → HedenFinanciering: BOF - projecten
- Een snelle, minimaal-invasieve en betaalbare test voor accurate diagnose van 'CUP' (Cancer of Unknown Primary: metastatische kanker van onbekende oorsprong) door bepaling van het DNA methylatie profiel.Vanaf1 nov 2020 → HedenFinanciering: FWO Strategische Onderzoeksbeurs
- Niet-invasieve predictie van immuuntherapie respons bij longkankerpatiëntenVanaf1 okt 2020 → HedenFinanciering: VZW en equivalenten
- Ontwikkeling van een niet-invasieve test voor het voorspellen van immuuntherapie respons bij longkankerVanaf1 okt 2020 → HedenFinanciering: FWO junior postdoctoraal mandaat
- Niet-invasieve predictie van immuuntherapie respons voor longkanker patiëntenVanaf1 nov 2019 → HedenFinanciering: BOF - projecten
- BOF-ZAP-ambt in Translationele genomica en bio-informaticaVanaf1 okt 2019 → HedenFinanciering: BOF - ZAP BOF mandaten
Publicaties
1 - 10 van 216
- The feasibility of using liquid biopsies as a complementary assay for copy number aberration profiling in routinely collected paediatric cancer patient samples(2022)
Auteurs: Ruben Van Paemel, Charlotte Vandeputte, Lennart Raman, Jolien Van Thorre, Leen Willems, Jo Van Dorpe, Malaïka Van der Linden, Jilke De Wilde, Andries De Koker, Björn Menten, et al.
Pagina's: 12 - 23 - MEIS2 is an adrenergic core regulatory transcription factor involved in early initiation of TH-MYCN-driven neuroblastoma formation(2021)
Auteurs: Jolien De Wyn, Mark W. Zimmerman, Nina Weichert-Leahey, Carolina de Carvalho Nunes, Belamy B. Cheung, Brian J. Abraham, Anneleen Beckers, Pieter-Jan Volders, Bieke Decaesteker, Daniel R. Carter, et al.
Aantal pagina's: 1 - From DNA copy number gains and tumor dependencies to novel therapeutic targets for high-risk neuroblastoma(2021)
Auteurs: Bieke Decaesteker, Kaat Durinck, Nadine Van Roy, Bram De Wilde, Christophe Van Neste, Stéphane Van Haver, Stephen Roberts, Katleen De Preter, Vanessa Vermeirssen, Franki Speleman
Aantal pagina's: 1 - Recurrent chromosomal imbalances provide selective advantage to human embryonic stem cells under enhanced replicative stress conditions(2021)
Auteurs: Liselot Mus, Stéphane Van Haver, Mina Popovic, Wim Trypsteen, Steve Lefever, Nadja Zeltner, Yudelca Ogando, Eva Jacobs, Geertrui Denecker, Ellen Sanders, et al.
Pagina's: 272 - 281 - Frequency and prognostic impact of ALK amplifications and mutations in the European Neuroblastoma Study Group (SIOPEN) high-risk neuroblastoma trial (HR-NBL1)(2021)
Auteurs: Angela Bellini, Ulrike Pötschger, Virginie Bernard, Eve Lapouble, Sylvain Baulande, Peter F. Ambros, Nathalie Auger, Klaus Beiske, Marie Bernkopf, David R. Betts, et al.
Pagina's: 3377 - 3390 - SOX11 as guardian of epigenetic plasticity in neuroblastoma(2021)
Auteurs: Bieke Decaesteker, Amber Louwagie, Siebe Loontiens, Sara De Brouwer, Carolina de Carvalho Nunes, Geertrui Denecker, Fanny De Vloed, Lisa Depestel, Juliette Roels, Karen Verboom, et al.
Aantal pagina's: 1 - Genome-wide study of the effect of blood collection tubes on the cell-free DNA methylome(2021)
Auteurs: Ruben Van Paemel, Andries De Koker, Christa Caggiano, Annelien Morlion, Pieter Mestdagh, Bram De Wilde, Joke Vandesompele, Katleen De Preter
Pagina's: 797 - 807 - The RNA Atlas expands the catalog of human non-coding RNAs (June, 10.1038/s41587-021-00936-1, 2021)(2021)
Auteurs: Lucia Lorenzi, Hua-Sheng Chiu, Francisco Avila Cobos, Stephen Gross, Pieter-Jan Volders, Robrecht Cannoodt, Justine Nuytens, Katrien Vanderheyden, Jasper Anckaert, Steve Lefever, et al.
Pagina's: 1467 - 1467 - Minimally invasive classification of pediatric solid tumors using reduced representation bisulfite sequencing of cell-free DNA : a proof-of-principle study(2021)
Auteurs: Ruben Van Paemel, Andries De Koker, Charlotte Vandeputte, Lieke van Zogchel, Tim Lammens, Genevieve Laureys, Joke Vandesompele, Gudrun Schleiermacher, Mathieu Chicard, Nadine Van Roy, et al.
Pagina's: 196 - 208 - The ETS transcription factor ETV5 is a target of activated ALK in neuroblastoma contributing to increased tumour aggressiveness(2020)
Auteurs: Liselot Mus, Irina Lambertz, Shana Claeys, Candy Kumps, Wouter Van Loocke, Christophe Van Neste, Ganesh Umapathy, Marica Vaapil, Christoph Bartenhagen, Genevieve Laureys, et al.
Aantal pagina's: 1