Onderzoeker
Katleen De Preter
- Trefwoorden (Ghent University):computationele deconvolutie, biomerker studies, genomica, vloeibare biopten, 'single' cel analyse, DNA en RNA sequenering, bioinformatica
- Disciplines (Flanders Institute for Biotechnology):Analytische biochemie, Celdood en senescentie, Analyse van next-generation sequence data, Algemene diagnostiek
- Disciplines (Ghent University):Genomics, Medische metagenomics, Medische genomics, Medische epigenomics, Kankerdiagnose, Kankerbiologie, Moleculaire diagnostiek
Affiliaties
- De Preter Lab (Onderzoeksgroep)
Verantwoordelijke
Vanaf25 okt 2022 → Heden - Vakgroep Biomoleculaire Geneeskunde (Departement)
Lid
Vanaf1 okt 2018 → Heden - Vakgroep Pediatrie en genetica (Departement)
Lid
Vanaf1 okt 2000 → 30 sep 2018
Projecten
1 - 10 of 19
- Een pragmatische klinische studie van SIOPEN om neuroblastoma terugval te monitoren met vloeibare biopsieVanaf1 jan 2024 → HedenFinanciering: HORIZON.2.1 - Gezondheid
- Universeel, kosten-effectief open-source technologieplatform voor lichaamsvloeistof-biopsie met hoge gevoeligheid, gebaseerd op het profileren van het methyloom van circulerend DNA.Vanaf1 jan 2024 → HedenFinanciering: BOF - projecten
- NIPITplus, een multi-kanker bloed test om immuun checkpoint inhibitie respons te voorspellen en toxiciteit te monitorenVanaf1 jan 2023 → HedenFinanciering: Stichtingen, fondsen e.d. met wetenschappelijk oogmerk
- Opvolgen van epigenetische plasticiteit in circulerend tumor DNA met het oog op monitoren van therapie resistentie voor gepersonaliseerde behandeling in kanker patiëntenVanaf1 sep 2022 → 31 dec 2022Financiering: HORIZON.1.1 - European Research Council (ERC)
- SpatialConnect: het connecteren van weefselbiologie met de spatiale genexpressie per individuele celVanaf1 mei 2022 → HedenFinanciering: FWO Middelzware apparatuur
- Replicatievork protectiefactoren als nieuwe doelwitten voor ombinatietherapie en immunomodulering (REINFORCE)Vanaf1 jan 2022 → HedenFinanciering: BOF - projecten
- DNA methylatie in Common Variable Immunodeficiencies (CVID): een gedetailleerde studie naar DNA methylatie heterogeniteit en relatie met ziekte klassificatieVanaf1 nov 2021 → HedenFinanciering: FWO mandaten
- Predictie van immuuntherapie response en toxiciteit in melanoom, nier- en longkanker door een transcriptoom gebaseerde immuun profilering.Vanaf1 nov 2021 → HedenFinanciering: FWO mandaten
- Ontwikkeling van een minimaal-invasieve test voor accurate diagnose van CUP ("Cancer of Unknown primary") door bepaling van het DNA methylatie profielVanaf1 okt 2021 → HedenFinanciering: BOF - projecten
- Een snelle, minimaal-invasieve en betaalbare test voor accurate diagnose van 'CUP' (Cancer of Unknown Primary: metastatische kanker van onbekende oorsprong) door bepaling van het DNA methylatie profiel.Vanaf1 nov 2020 → 31 okt 2022Financiering: FWO Strategische Onderzoeksbeurs
Publicaties
11 - 20 van 66
- Opportunities and challenges in interpretable deep learning for drug sensitivity prediction of cancer cells(2022)
Auteurs: Bikash Ranjan Samal, Jens Uwe Loers, Vanessa Vermeirssen, Katleen De Preter
- Digital PCR-based evaluation of nucleic acid extraction kit performance for the co-purification of cell-free DNA and RNA(2022)
Auteurs: Jill Deleu, Kathleen Schoofs, Anneleen Decock, Kimberly Verniers, Sofie Roelandt, Angie Denolf, Joke Verreth, Bram De Wilde, Tom Van Maerken, Katleen De Preter, et al.
- RRM2 enhances MYCN-driven neuroblastoma formation and acts as a synergistic target with CHK1 inhibition(2022)
Auteurs: Carolina de Carvalho Nunes, Lisa Depestel, Liselot Mus, Kaylee M. Keller, Louis Delhaye, Amber Louwagie, Muhammad Rishfi, Alex Whale, Neesha Kara, Simon R. Andrews, et al.
- Recurrent chromosomal imbalances provide selective advantage to human embryonic stem cells under enhanced replicative stress conditions(2021)
Auteurs: Liselot Mus, Stéphane Van Haver, Mina Popovic, Wim Trypsteen, Steve Lefever, Nadja Zeltner, Yudelca Ogando, Eva Jacobs, Geertrui Denecker, Ellen Sanders, et al.
Pagina's: 272 - 281 - Frequency and prognostic impact of ALK amplifications and mutations in the European Neuroblastoma Study Group (SIOPEN) high-risk neuroblastoma trial (HR-NBL1)(2021)
Auteurs: Angela Bellini, Ulrike Pötschger, Virginie Bernard, Eve Lapouble, Sylvain Baulande, Peter F. Ambros, Nathalie Auger, Klaus Beiske, Marie Bernkopf, David R. Betts, et al.
Pagina's: 3377 - 3390 - MEIS2 is an adrenergic core regulatory transcription factor involved in early initiation of TH-MYCN-driven neuroblastoma formation(2021)
Auteurs: Jolien De Wyn, Mark W. Zimmerman, Nina Weichert-Leahey, Carolina de Carvalho Nunes, Belamy B. Cheung, Brian J. Abraham, Anneleen Beckers, Pieter-Jan Volders, Bieke Decaesteker, Daniel R. Carter, et al.
- The RNA Atlas expands the catalog of human non-coding RNAs(2021)
Auteurs: Lucia Lorenzi, Hua-Sheng Chiu, Francisco Avila Cobos, Stephen Gross, Pieter-Jan Volders, Robrecht Cannoodt, Justine Nuytens, Katrien Vanderheyden, Jasper Anckaert, Steve Lefever, et al.
Pagina's: 1453 - 1465 - The ETS transcription factor ETV5 is a target of activated ALK in neuroblastoma contributing to increased tumour aggressiveness(2020)
Auteurs: Liselot Mus, Irina Lambertz, Shana Claeys, Candy Kumps, Wouter Van Loocke, Christophe Van Neste, Ganesh Umapathy, Marica Vaapil, Christoph Bartenhagen, Genevieve Laureys, et al.
- Distinct Notch1 and BCL11B requirements mediate human γδ/αβ T cell development(2020)
Auteurs: Anne-Catherine Dolens, Kaat Durinck, Marieke Lavaert, Joni Van der Meulen, Imke Velghe, Jelle De Medts, Karin Weening, Juliette Roels, Katrien De Mulder, Pieter-Jan Volders, et al.
- Genetic alterations of ALK in high-risk neuroblastoma patients : a SIOPEN study(2019)Volume: 66
Auteurs: A. Bellini, V. Bernard, P. Ambros, Katleen De Preter, V. Combaret, K. Beiske, A. Vicha, R. Ladenstein, D. Valteau-Couanet, M. Rossing, et al.
Pagina's: S54 - S54