Onderzoeker
Katleen De Preter
- Trefwoorden (Ghent University):computationele deconvolutie, biomerker studies, genomica, vloeibare biopten, 'single' cel analyse, DNA en RNA sequenering, bioinformatica
- Disciplines (Flanders Institute for Biotechnology):Analytische biochemie, Celdood en senescentie, Analyse van next-generation sequence data, Algemene diagnostiek
- Disciplines (Ghent University):Genomics, Medische metagenomics, Medische genomics, Medische epigenomics, Kankerdiagnose, Kankerbiologie, Moleculaire diagnostiek
Affiliaties
- De Preter Lab (Onderzoeksgroep)
Verantwoordelijke
Vanaf25 okt 2022 → Heden - Vakgroep Biomoleculaire Geneeskunde (Departement)
Lid
Vanaf1 okt 2018 → Heden - Vakgroep Pediatrie en genetica (Departement)
Lid
Vanaf1 okt 2000 → 30 sep 2018
Projecten
11 - 19 of 19
- Ontwikkeling van een niet-invasieve test voor het voorspellen van immuuntherapie respons bij longkankerVanaf1 okt 2020 → HedenFinanciering: FWO junior postdoctoraal mandaat
- Niet-invasieve predictie van immuuntherapie respons bij longkankerpatiëntenVanaf1 okt 2020 → HedenFinanciering: VZW en equivalenten
- Niet-invasieve predictie van immuuntherapie respons voor longkanker patiëntenVanaf1 nov 2019 → HedenFinanciering: BOF - projecten
- BOF-ZAP-ambt in Translationele genomica en bio-informaticaVanaf1 okt 2019 → HedenFinanciering: BOF - ZAP BOF mandaten
- SOX11 gecontroleerde SWI / SNF combinatorische assemblage en neuroblastoom super-enhancer landschapsarchitectuurVanaf1 okt 2018 → 30 sep 2019Financiering: Stichtingen, fondsen e.d. met wetenschappelijk oogmerk
- Niet-invasieve medicatie-identificatie voor tumoren (NIDIT): een hulpmiddel voor precisiek oncologieVanaf1 okt 2017 → 30 sep 2023Financiering: VZW en equivalenten
- Ontwikkeling van een data-analyse pijplijn voor drug doelwit identificatie uit het circulerend transcriptoom van longtumor patiënten.Vanaf1 jan 2017 → 15 feb 2020Financiering: BOF - Nieuwe Onderzoeksinitiatieven
- Gen-omgevingsinteracties in de pathogenese van longaandoeningen veroorzaakt door rokenVanaf1 jan 2014 → 31 okt 2019Financiering: BOF - Geconcert. Onderzoeksacties vanaf 1994
- Bioinformatica voor toekomstige precisiegeneeskunde in de behandeling van kankerVanaf1 okt 2013 → 30 sep 2015Financiering: VZW en equivalenten
Publicaties
1 - 10 van 66
- MYCN and SNRPD3 cooperate to maintain a balance of alternative splicing events that drives neuroblastoma progression(2024)
Auteurs: Alice Salib, Nisitha Jayatilleke, Janith A. Seneviratne, Chelsea Mayoh, Katleen De Preter, Franki Speleman, Belamy B. Cheung, Daniel R. Carter, Glenn M. Marshall
Pagina's: 363 - 377 - Evaluation of single-sample network inference methods for precision oncology(2024)
Auteurs: Joke Deschildre, Boris Vandemoortele, Jens Uwe Loers, Katleen De Preter, Vanessa Vermeirssen
- Human iPSC modeling recapitulates in vivo sympathoadrenal development and reveals an aberrant developmental subpopulation in familial neuroblastoma(2024)
Auteurs: Stéphane Van Haver, Yujie Fan, Sarah-Lee Bekaert, Celine Everaert, Wouter Van Loocke, Vittorio Zanzani, Joke Deschildre, Ines Fernandez Maestre, Adrianna Amaro, Vanessa Vermeirssen, et al.
- Cell-free DNA as a diagnostic and prognostic biomarker in pediatric rhabdomyosarcoma(2023)
Auteurs: Nathalie S.M. Lak, Lieke M.J. van Zogchel, Lily Zappeij-Kannegieter, Ahmad Javadi, Ruben Van Paemel, Charlotte Vandeputte, Katleen De Preter, Bram De Wilde, Mathieu Chicard, Yasmine Iddir, et al.
- Performance evaluation of RNA purification kits and blood collection tubes in the Extracellular RNA Quality Control (exRNAQC) study(2023)
Auteurs: Anneleen Decock, Olivier De Wever, Celine Everaert, Hetty Helsmoortel, An Hendrix, Pieter Mestdagh, Annelien Morlion, Jo Vandesompele, Ruben Van Paemel, Francisco Avila Cobos, et al.
Aantal pagina's: 1 - Performance evaluation of RNA purification kits and blood collection tubes in the Extracellular RNA Quality Control (exRNAQC) study(2023)
Auteurs: Anneleen Decock, Olivier De Wever, Celine Everaert, Hetty Helsmoortel, An Hendrix, Pieter Mestdagh, Annelien Morlion, Jo Vandesompele, Ruben Van Paemel, Francisco Avila Cobos, et al.
Aantal pagina's: 1 - Mitotic dysregulation at tumor initiation creates a therapeutic vulnerability to combination anti-mitotic and pro-apoptotic agents for MYCN-driven neuroblastoma(2023)
Auteurs: Lei Zhai, Anushree Balachandran, Rebecca Larkin, Janith A. Seneviratne, Sylvia A. Chung, Amit Lalwani, Shoma Tsubota, Dominik Beck, Kenji Kadomatsu, Anneleen Beckers, et al.
- Dramatic impact of blood collection tube and RNA purification method on extracellular RNA transcriptomes(2023)
Auteurs: Jasper Anckaert, Francisco Avila Cobos, Anneleen Decock, Philippe Decruyenaere, Jill Deleu, Katleen De Preter, Olivier De Wever, Jilke De Wilde, Bert Dhondt, Thibaut D'huyvetter, et al.
Aantal pagina's: 1 - Circulating immune cell dynamics as outcome predictors for immunotherapy in non-small cell lung cancer(2023)
Auteurs: Alvaro Marcos Rubio, Celine Everaert, Eufra Van Damme, Katleen De Preter, Karim Vermaelen
- Memory of stochastic single-cell apoptotic signaling promotes chemoresistance in neuroblastoma(2023)
Auteurs: Jordan F. Hastings, Sharissa L. Latham, Alvin Kamili, Madeleine S. Wheatley, Jeremy Z. R. Han, Marie Wong-Erasmus, Monica Phimmachanh, Max Nobis, Chiara Pantarelli, Antonia L. Cadell, et al.