Projecten
Next-generation sequencing (NGS) als een tool in virusdiagnostiek: een case study voor de identificatie van nieuwe schadelijke plantenvirussen in België Instituut voor Landbouw-, Visserij- en Voedingsonderzoek
Dit project had tot doel om de niet-doelgerichte en dus heel brede ‘High Throughput Sequencing’-techniek, die in de wereld van de diagnose opgang maakt, beschikbaar te maken voor plantenvirussen. Als case hebben de onderzoekers zich op Solanaceae (nachtschadefamilie) gericht, een belangrijke plantenfamilie waartoe aardappel, en ook tomaat, paprika en aubergine behoren. Deze teelten zijn ...
Next-generation sequencing diagnostiek om etiologieën van acute ongedifferentieerde koorts in het Peruaanse amazonegebied te identficeren Instituut voor Tropische Geneeskunde
In de tropen blijft ~50% van de patiënten met acute ongedifferentieerde koortsaandoeningen (AUFI) ongediagnosticeerd. De differentiële diagnose, die belangrijk is om de behandeling en het casemanagement te sturen, wordt bemoeilijkt door verschillende factoren, waaronder een grote verscheidenheid aan (on)bekende ziekteverwekkers die AUFI veroorzaken, een groot aantal overlappende symptomen waardoor klinische diagnoses onbetrouwbaar zijn, ...
Nieuwe generatie sequencing voor een grondige transcriptoom analyse van een tropische plant-schimmel interactie (NEGENTROP). KU Leuven
Identificatie en karakterisering van nieuwe causale genen voor Lewy Body hersenziekten door middel van next-generation sequencing. Universiteit Antwerpen
LeapSEQ: Efficiënte data processing oplossingen voor adaptieve en mobiele genoom sequencing, toegepast op monitoring van infectieziekten. Universiteit Antwerpen
Implementatie van long-read metagenomische sequencing in precisiegeneeskunde en antibioticabeleid bij acute luchtweginfecties. Universiteit Antwerpen
Derde generatie sequencing voor de detectie van cryptische structurele genoom en methyloom variatie in patienten met ontwikkelingsstoornissen. KU Leuven
Twee decennia geleden werd de voltooiing aangekondigd van een kaart van het menselijk genoom. Die is essentieel gebleken bij het bepalen van de genetische basis van ziektes. Helaas kon 10% van het genoom niet worden geanalyseerd. Ongeveer 40% van de patiënten blijft tot op vandaag zonder moleculaire verklaring voor hun aandoening. Nu kunnen we, door middel van revolutionaire long read sequencing-technologie, voor het eerst deze verborgen ...