Onderzoeker
Filip Van Nieuwerburgh
- Trefwoorden:Massively parallel sequencing, Toegepaste bio-informatica
- Disciplines:Farmogenetica en -genomica, Genetica, Epigenetica, Immunogenetica
Affiliaties
- Vakgroep Geneesmiddelenleer (Departement)
Lid
Vanaf1 sep 1999 → Heden
Infrastructuur
1 - 2 van 2
Projecten
1 - 10 of 28
- Democratisering van High-Throughput Next Generation Sequencing in verschillende Life Sciencevelden: de AVITI Next Generation Sequencer.Vanaf1 mei 2024 → HedenFinanciering: FWO Middelzware apparatuur
- Ontrafelen van de rol van het immuunsysteem bij de ontwikkeling van hypergranulatieweefsel in wonden bij paardenVanaf1 jan 2024 → HedenFinanciering: BOF - doctorale mandaten
- Strategische Innovaties in Moleculaire GeneticaVanaf1 jan 2024 → HedenFinanciering: BOF - projecten
- Extracellulaire vesikels uit het follikelvocht zijn sleutelfactoren voor een betere ontwikkeling van verse en gevitrificeerde eicellen bij het paardVanaf16 okt 2023 → HedenFinanciering: BOF - postdoctorale mandaten
- qPCR systeem voor kwaliteitscontrole van NGS staalvoorbereiding, meting van genexpressie, hybridisatiecurve, en smeltcurve analyseVanaf15 dec 2022 → HedenFinanciering: BOF - wetenschappelijk apparatuurprogramma
- Cofinanciering kernfaciliteit - Gent Licht Microscopie (GLiM)Vanaf1 jul 2022 → HedenFinanciering: BOF - onderzoeksorganisaties
- Cofinanciering core facility - UGent NGS CoreVanaf1 jul 2022 → HedenFinanciering: BOF - onderzoeksorganisaties
- Modulaire high-end massaspectrometer voor ultragevoelige kwantificatie en beeldvorming van kleine organische moleculen in cross-health onderzoek - MSsmall-XHVanaf1 mei 2022 → HedenFinanciering: FWO Middelzware apparatuur
- Empirische exploratie van nieuwe DNA probes voor hybridisatie met tandem repeatsVanaf1 nov 2021 → HedenFinanciering: FWO Strategische Onderzoeksbeurs
- Nanopore-sequencing van complete farmacogenen na CRISPR/Cas9-verrijking bij tamoxifen- en clopidogrel-patiënten, waardoor verbeterde haplotypering en voorspelling van de werkzaamheid met machine learning mogelijk is.Vanaf1 okt 2021 → HedenFinanciering: BOF - doctorale mandaten
Publicaties
1 - 10 van 288
- Genome-wide methylome stability and parental effects in the worldwide distributed Lombardy poplar(2024)
Auteurs: An Vanden Broeck, Tim Meese, Pieter Verschelde, Karen Cox, Berthold Heinze, Dieter Deforce, Ellen De Meester, Filip Van Nieuwerburgh
- Applications of nanopore sequencing for forensic analysis(2024)
Auteurs: Olivier Tytgat, Filip Van Nieuwerburgh
Pagina's: 85 - 98 - Mycothione reductase as a potential target in the fight against Mycobacterium abscessus infections(2024)
Auteurs: T. Piller, L. De Vooght, Yannick Gansemans, Filip Van Nieuwerburgh, P. Cos
- Proteomics data in vitiligo : a scoping review(2024)
Auteurs: Danique Berrevoet, Filip Van Nieuwerburgh, Dieter Deforce, Reinhart Speeckaert
- Baselining physiological parameters in three muscles across three equine breeds : what can we learn from the horse?(2024)
Auteurs: Carmen Vidal Moreno de Vega, Constance De meeûs, Berit Boshuizen, Lorie De Maré, Yannick Gansemans, Filip Van Nieuwerburgh, Dieter Deforce, Klara Goethals, Ward De Spiegelaere, Luc Leybaert, et al.
- An in-depth investigation of the microbiota and its virulence factors associated with severe udder cleft dermatitis lesions(2024)
Auteurs: Anne-Sofie Vermeersch, M. Ali, Yannick Gansemans, Filip Van Nieuwerburgh, Richard Ducatelle, Peter Geldhof, Dieter Deforce, J. Callens, Geert Opsomer
Pagina's: 3219 - 3234 - Osteopontin characterizes bile duct-associated macrophages and correlates with liver fibrosis severity in primary sclerosing cholangitis(2024)
Auteurs: Kevin De Muynck, Lander Heyerick, Federico Francesco De Ponti, Bart Vanderborght, Tim Meese, Sanne Van Campenhout, Leen Baudonck, Eva Gijbels, Pedro M. Rodrigues, Jesus M. Banales, et al.
Pagina's: 269 - 288 - Effects of biologics treatment in type 2-high chronic rhinosinusitis with nasal polyp patients(2023)Volume: 151
Auteurs: Sharon Van Nevel, Tim Meese, Gabriële Holtappels, Natalie De Ruyck, Stijn Vanhee, Nan Zhang, Filip Van Nieuwerburgh, Claus Bachert
Pagina's: AB187 - AB187 - How do engineered Yarrowia lipolytica strains secrete free fatty acids : hints from comparative transcriptomics(2023)
Auteurs: José Manuel Salvador López, Lea Vidal, Michelle Patricia, Filip Van Nieuwerburgh, Dieter Deforce, Jean-Marc Nicaud, Inge Van Bogaert
- Identification of a novel idiopathic epilepsy risk locus and a variant in the CCDC85A gene in the Dutch partridge dog(2023)
Auteurs: Evy Beckers, Sofie Bhatti, Mario Van Poucke, Ingeborgh Polis, Frédéric Farnir, Filip Van Nieuwerburgh, Paul Mandigers, Luc Van Ham, Luc Peelman, Bart Broeckx
Patenten
1 - 2 van 2
- Hydrolysis-based probe and method for STR genotyping (Inventor)
- Probe and method for STR-genotyping (Inventor)