Onderzoeker
Filip Van Nieuwerburgh
- Trefwoorden:Massively parallel sequencing, Toegepaste bio-informatica
- Disciplines:Farmogenetica en -genomica, Genetica, Epigenetica, Immunogenetica
Affiliaties
- Vakgroep Geneesmiddelenleer (Departement)
Lid
Vanaf1 sep 1999 → Heden
Infrastructuur
1 - 1 van 1
- PromethION: nanopore sequencer met hoge doorvoer voor DNA en RNA sequenering met lange leeslengte. (Consortium coordinator)
Projecten
21 - 26 of 26
- Ontrafelen van de trichotheceen afbraakwegen voor valorisatie in
remediatiestrategieën voor en na de oogstVanaf1 jan 2017 → 31 dec 2018Financiering: FWO Strategische Onderzoeksbeurs
- IsoFlux Systeem: Isolatie van laag abundante cellen uit biologische stalenVanaf1 jun 2015 → 31 mei 2017Financiering: BOF - Andere acties
- Ontwikkelen en valideren van een geïntegreerd Lab-on-a-ChipVanaf1 okt 2014 → 30 sep 2018Financiering: IWT persoonsgebonden financ. - strategische onderzoeksbeurzen, IWT persoonsgebonden financ. - specialisatiebeurzen
- Basisuitrusting: Ion Personal Genome Machine TM (PGM TM) Sequencer en Ion Proton TM SequencerVanaf15 jun 2012 → 14 jun 2014Financiering: BOF - Andere acties
- Artemisinine biosynthese in Artemisia annua trichomenVanaf1 jan 2012 → 31 dec 2014Financiering: FWO Krediet aan Navorser
- Kweek-afhankelijke en -onafhankelijke analyse van de bio-film-geassocieerde microflora op endotracheale tubes en hun rol in ventilator-geassocieerde pneumonieVanaf1 jan 2011 → 31 dec 2014Financiering: FWO Onderzoeksproject (incl. WEAVE projecten)
Publicaties
1 - 10 van 274
- Applications of nanopore sequencing for forensic analysis(2024)
Auteurs: Olivier Tytgat, Filip Van Nieuwerburgh
Pagina's: 85 - 98 - Osteopontin characterizes bile duct-associated macrophages and correlates with liver fibrosis severity in primary sclerosing cholangitis(2024)
Auteurs: Kevin De Muynck, Lander Heyerick, Federico Francesco De Ponti, Bart Vanderborght, Tim Meese, Sanne Van Campenhout, Leen Baudonck, Eva Gijbels, Pedro M. Rodrigues, Jesus M. Banales, et al.
Pagina's: 269 - 288 - Post-feeding transcriptomics reveals essential genes expressed in the midgut of the desert locust(2023)
Auteurs: Joachim Van Lommel, Michiel Holtof, Laurentijn Tilleman, Dorien Cools, Seppe Vansteenkiste, Daria Polgun, Rik Verdonck, Filip Van Nieuwerburgh, Jozef Vanden Broeck
- Single-cell profiling identifies a novel human polyclonal unconventional T cell lineage(2023)
Auteurs: Lore Billiet, Laurenz De Cock, Guillem Sanchez Sanchez, Rupert Mayer, Glenn Goetgeluk, Stijn De Munter, Melissa Pille, Joline Ingels, Hanne Jansen, Karin Weening, et al.
- New insights into the combined toxicity of aflatoxin B1 and fumonisin B1 in HepG2 cells using Seahorse respirometry analysis and RNA transcriptome sequencing(2023)
Auteurs: Xiangrong Chen, Mohamed Fathi Abdallah Abdelmohsen, Charlotte Grootaert, Filip Van Nieuwerburgh, Andreja Rajkovic
- Targeted haplotyping in pharmacogenomics using Oxford Nanopore Technologies' adaptive sampling(2023)
Auteurs: Koen Deserranno, Laurentijn Tilleman, Kaat Rubben, Dieter Deforce, Filip Van Nieuwerburgh
- Comparative transcriptomics of porcine liver-resident CD8αdim, liver CD8αhigh and circulating blood CD8αhigh NK cells reveals an intermediate phenotype of liver CD8αhigh NK cells(2023)
Auteurs: Leen Hermans, Sofie Denaeghel, Robert J. J. Jansens, Steffi De Pelsmaeker, Filip Van Nieuwerburgh, Dieter Deforce, Everardo Hegewisch-Solloa, Emily M. Mace, Eric Cox, Bert Devriendt, et al.
- Dynamics of training and acute exercise-induced shifts in muscular glucose transporter (GLUT) 4, 8, and 12 expression in locomotion versus posture muscles in healthy horses(2023)
Auteurs: Carmen Vidal Moreno de Vega, Diete Lemmens, Constance de Meeus d'Argenteuil, Berit Boshuizen, Lorie De Maré, Luc Leybaert, Klara Goethals, Jean Eduardo de Oliveira, Guilherme Hosotani, Dieter Deforce, et al.
- Identification and profiling of a novel Bombyx mori latent virus variant acutely infecting Helicoverpa armigera and Trichoplusia ni(2023)
Auteurs: Thomas-Wolf Verdonckt, Anton Bilsen, Filip Van Nieuwerburgh, Loes De Troij, Dulce Santos, Jozef Vanden Broeck
- Cathepsin-L secreted by high-quality bovine embryos exerts an embryotrophic effect in vitro(2023)
Auteurs: Annelies Raes, Eline Wydooghe, Krishna Pavani, Osvaldo Américo Bogado Pascottini, Katleen Van Steendam, Maarten Dhaenens, Sonia Heras, Luc Peelman, Dieter Deforce, Filip Van Nieuwerburgh, et al.
Patenten
1 - 2 van 2
- Hydrolysis-based probe and method for STR genotyping (Inventor)
- Probe and method for STR-genotyping (Inventor)