Projecten
In vitro reconstructie van proteïne secretie via het type 3-systeem. KU Leuven
Het type III secretiesysteem is een gespecialiseerde proteïne-exportroute. De centrale component is het injectisome, een miniatuur spuit die uit de bacteriële cellen steekt. Pathogene bacteriën gebruiken dit om toxines direct in eukaryote cellen te leveren. Voor de pathogeniteitcontrole moeten we begrijpen hoe dat de injectisome eruit ziet en hoe het werkt. Al vele jaren hebben wetenschappers geprobeerd om dit te doen in levende bacteriën ...
Ontrafelen en optimaliseren van de secretie van recombinante proteïnen in gist KU Leuven
Het gebruik van celfabrieken voor de productie van recombinante eiwitten, zoals biofarmaceutica of industriële enzymen, is een snelgroeiende industrie. Er is een breed scala aan expressiesystemen beschikbaar, variërend van prokaryotische microben tot meercellige eukaryotische systemen zoals planten of zoogdieren, die elk hun specifieke voor- en nadelen hebben. De gist S. cerevisiae is één van de meest gebruikte celfabrieken, omdat het een ...
Conformationele dynamiek in de Sec secretieweg KU Leuven
Eiwit biogenese is een complex proces dat voorkomt bij proteïnes met een functie in extracytoplasmatische cellulaire compartimenten, of daarbuiten. Deze proteïnes vertegenwoordigen meer dan één derde van elk proteoom. Hun opvouwing is tijdelijk en plaatselijk losgekoppeld van de eiwittranslatie. Bovendien is het noodzakelijk dat deze proteïnen naar de export machines worden gericht en door deze getransloceerd worden. De meeste geëxporteerde ...
De rol van de triggerfactor-chaperonne bij het sorteren van eiwitten en het richten op secretie, acroniem: TFaST KU Leuven
De rol van de triggerfactor-chaperonne bij eiwitsortering en secretoire targeting (TFaST) heeft tot doel licht te werpen op de universele processen van eiwitvouwing en -secretie door verder te gaan dan de beschikbare statische structuren en de structurele dynamische basis van deze processen te bepalen, waarbij de nadruk vooral ligt op de bijdragen van de triggerfactor (TF)-chaperonne. De afgelopen 40 jaar is het duidelijk geworden dat het ...
In vitro reconstitutie van eiwitsecretie doorheen het Type 3 systeem KU Leuven
Eiwitten moeten, om correct te werken, hun finale subcellulaire bestemmingen bereiken en hun finale 3D structuur aannemen. Daarom zijn het targeting en transport van eiwitten essentieel cellulair processen in alle levensrijken. Begrijpen hoe eiwitten worden getransporteerd en gevouwen worden tot een functioneel eiwit, onthult de fundamentele aspecten van cellulaire eiwitbiologie, zoals celwandbiogenese, celdeling, ...
Eiwitvouwoscillaties in het secretoom KU Leuven
De 3D niet-natieve code voor eiwit sortering en targeting KU Leuven
Proteïnen zijn essentieel voor het leven: ze zorgen voor celdeling en geven structuur/beweging aan cellen en weefsels. Alle proteïnen worden gesynthetiseerd door ribosomen in het cytoplasma als niet-gevouwen aminozuurketens die hun correcte cel locatie moeten vinden en hun functionele vorm moeten aannemen. Deze processen zijn belangrijk: proteïnemislokalisatie en -misvouwing zijn schadelijk en leiden tot ziektes. In Gram-negatieve bacteriën ...
Structurele dynamiek van sortering, targeting, translocatie van secretoire eiwitten (DynamicSTarT) KU Leuven
Het Sec-secretiesysteem is de algemene en essentiële eiwitexportroute gedurende het hele leven. Het centrale onderdeel is de Sec translocase, een nanomachine die geëxporteerde eiwitten herkent en uit celmembranen haalt. Pathogene bacteriën gebruiken het Sec-systeem om eiwitten zoals toxines te exporteren. Om pathogeniteit te beheersen en te exploiteren voor de productie van biofarmaceutica, moeten we begrijpen hoe het werkt. Wetenschappers ...
Dynamiek van het Type 3 secretie systeem translocase (DOT3S) KU Leuven
Het type III secretiesysteem voert gespecialiseerde eiwitexport uit. Waar centraal het injectisoom, een miniatuurspuit die eukaryote membranen doorprikt, staat. Hiermee injecteren pathogene bacteriën de gastheer met gifstoffen. Om hun pathogeniteit te onderdrukken, moeten we de structuur en functie van het injectisoom begrijpen. De algemene werkwijze is door bij levende bacteriën injectisoomcomponenten te verwijderen en ze met krachtige ...