Onderzoeker
Petra Van Damme
- Trefwoorden:genoom (re-)annotatie, (alternatieve) translatie initiatie, bacteriële pathogeen, proteovormen, proteomics, riboproteogenomics, gastheer-microbe interactie
- Disciplines:Transcriptie en translatie, Proteomics, Transcriptomics, Interactomics, Infectieziekten
Affiliaties
- Vakgroep Biochemie en Microbiologie (Departement)
Lid
Vanaf1 mrt 2019 → Heden - Vakgroep Biomoleculaire Geneeskunde (Departement)
Lid
Vanaf1 okt 2018 → 28 feb 2019 - Vakgroep Plantenbiotechnologie en Bio-informatica (Departement)
Lid
Vanaf1 mei 2018 → 30 sep 2018 - Vakgroep Biochemie (Departement)
Lid
Vanaf1 feb 2003 → 30 sep 2018 - Vakgroep Biomedische Moleculaire Biologie (Departement)
Lid
Vanaf1 jan 2002 → 31 aug 2002
Projecten
1 - 10 of 10
- Nieuwe mechanismen van ontsteking en celdood regulatie in autoinflammatoire ziekten en infectiesVanaf1 jan 2023 → HedenFinanciering: BOF - projecten
- Microarrays voor de fenotypische karakterisatie van reinculturen, bacteriële mutanten en microbiële gemeenschappenVanaf15 dec 2022 → HedenFinanciering: BOF - wetenschappelijk apparatuurprogramma
- Het ontrafelen van de heterogene aard van gastheer/pathogeen interacties en hun rol in bacteriële pathogenese.Vanaf1 jan 2021 → HedenFinanciering: FWO Onderzoeksproject (incl. WEAVE projecten)
- Preparatieve en analytische ultracentrifugatie ter ondersteuning van integratieve multi-omics studies.Vanaf1 dec 2020 → 30 nov 2022Financiering: BOF - wetenschappelijk apparatuurprogramma
- Een MALDI-8020 massaspectrometer voor analyse van peptiden en eiwitten.Vanaf1 dec 2020 → 30 nov 2022Financiering: BOF - wetenschappelijk apparatuurprogramma
- Riboproteogenomics van het sORF-gecodeerde SalmonellapeptidoomVanaf1 jan 2020 → 31 dec 2023Financiering: FWO Onderzoeksproject (incl. WEAVE projecten)
- Proteogenomics exploratie van de moleculaire mechanismen die aan de basis liggen van Salmonella infectieVanaf1 okt 2019 → 31 mrt 2022Financiering: BOF - postdoctorale mandaten
- Riboproteogenomics van de interactie tussen bacteriële pathogeen en zijn gastheerVanaf15 apr 2019 → 14 feb 2024Financiering: BOF - projecten
- PROFETIE: Translationele controle in infectiebiologie: riboproteogenomics van bacteriële pathogenenVanaf1 nov 2018 → 31 okt 2023Financiering: H2020-EU.1.1 - EXCELLENT SCIENCE - Europese Onderzoeksraad (ERC)
- BOF-ZAP-ambt in proteomicaVanaf1 okt 2018 → HedenFinanciering: BOF - ZAP BOF mandaten
Publicaties
11 - 20 van 38
- Ablation of elongation factor 2 kinase enhances heat-shock protein 90 chaperone expression and protects cells under proteotoxic stress(2019)
Auteurs: Jianling Xie, Petra Van Damme, Danielle Fang, Christopher G. Proud
Pagina's: 7169 - 7176 - Omics assisted N-terminal proteoform and protein expression profiling on methionine aminopeptidase 1 (MetAP1) deletion(2018)
Auteurs: Veronique Jonckheere, Daria Fijalkowska, Petra Van Damme
Pagina's: 694 - 708 - Limitless translation limits translation(2018)
Auteurs: Petra Van Damme
Pagina's: 289 - 290 - N-terminal proteomics assisted profiling of the unexplored translation initiation landscape in Arabidopsis thaliana(2017)
Auteurs: Patrick Willems, Elvis Ndah, Veronique Jonckheere, Simon Stael, Adriaan Sticker, Lennart Martens, Frank Van Breusegem, Kris Gevaert, Petra Van Damme
Pagina's: 1064 - 1080 - Noncoding after all : biases in proteomics data do not explain observed absence of lncRNA translation products(2017)
Auteurs: Kenneth Verheggen, Pieter-Jan Volders, Pieter Mestdagh, Gerben Menschaert, Petra Van Damme, Kris Gevaert, Lennart Martens, Jo Vandesompele
Pagina's: 2508 - 2515 - Identification of carboxypeptidase substrates by C-terminal COFRADIC(2017)Series: Methods in Molecular Biology
Auteurs: Sebastian Tanco, Francesc Xavier Aviles, Kris Gevaert, Julia Lorenzo, Petra Van Damme, Oliver Schilling
Pagina's: 115 - 133 - Protease substrate profiling by N-terminal COFRADIC(2017)Series: Methods in Molecular Biology
Auteurs: An Staes, Petra Van Damme, Evy Timmerman, Bart Ruttens, Elisabeth Stes, Kris Gevaert, Francis Impens, Oliver Schilling
Pagina's: 51 - 76 - Absence of N-terminal acetyltransferase diversification during evolution of eukaryotic organisms(2016)
Auteurs: Om Singh Rathore, Alexandra Faustino, Pedro Prudêncio, Petra Van Damme, Cymon J Cox, Rui Gonçalo Martinho
- A role for human N-alpha acetyltransferase 30 (Naa30) in maintaining mitochondrial integrity(2016)
Auteurs: Petra Van Damme, Thomas V Kalvik, Kristian W Starheim, Veronique Jonckheere, Line M Myklebust, Gerben Menschaert, Jan Erik Varhaug, Kris Gevaert, Thomas Arnesen
Pagina's: 3361 - 3372 - Proteomic identification of cysteine cathepsin substrates shed from the surface of cancer cells(2015)
Auteurs: Barbara Sobotic, Matej Vizovisek, Robert Vidmar, Petra Van Damme, Vasilena Gocheva, Johanna A Joyce, Kris Gevaert, Vito Turk, Boris Turk, Marko Fonovic
Pagina's: 2213 - 2228