SOX11 gecontroleerde SWI / SNF combinatorische assemblage en neuroblastoom super-enhancer landschapsarchitectuur

Neuroblastoom (NB) is de derde meest voorkomende tumor die ontstaat tijdens de vroege kinderjaren en die voortkomt uit zenuwweefsel buiten de hersenen. NB's met een hoog risico en een slechte prognose vertonen zeer weinig mutaties, maar vertonen een typisch terugkerend patroon van winst of verlies van chromosomale segmenten. Aangenomen wordt dat deze laatste dosiseffecten veroorzaken voor eiwitten die bijdragen aan tumorvorming en / of -progressie. In mijn project stel ik voor om een ​​spannende nieuwe bevinding van Bieke Decaesteker (FWO-aspirant) die het SOX11-gen heeft geïdentificeerd als een belangrijke regulator van genactiviteit en het beheersen van doelgenen die betrokken zijn bij een regulerend eiwitcomplex (SWI genoemd), verder te onderzoeken. SNF) die is gemuteerd in tot 20% van alle kankerentiteiten. Nog opmerkelijker is dat een van de door SOX11 gereguleerde SWI / SNF-subeenheden PHF10 is, waarvan onlangs door het gastlaboratorium werd vastgesteld dat het geassocieerd was met NB met een ultrahoog risico. In mijn project wil ik (1) de effecten van SOX11 op het tumorfenotype verder bestuderen met behulp van een nieuwe elegante methode voor eiwitafbraak, (2) een gedetailleerde karakterisering uitvoeren van hoe SOX11 interageert met de regulerende elementen van zijn doelgenen en ( 3) tot slot zal ik de studie van PHF10 starten als een potentiële aanjager van tumoragressiviteit. Dit zal uiteindelijk leiden tot het begrijpen van de fundamentele onderliggende mechanismen van NB die bijdragen aan nieuwe gerichte therapieën.