Projecten
Optische Genoom Mapping en long-read sequencing in lymfomen KU Leuven
Non-Hodgkin Lymfoom is een veel voorkomende hematologische maligniteit. Het is een heterogene ziekte die geclassificeerd kan worden in meer dan 60 verschillende entiteiten op basis van morfologie, immunofenotype en klinische karakteristieken. Genetische data wordt meer en meer geïntegreerd bij de classificatie van NHL, wat de diagnose bevordert en belangrijke voorspellende biomarkers voorziet. Dit laat aangepaste therapieën toe. Deze ...
Surface Imprinted Polymers technology and nanopore sequencing for point of care food microbial analysis Flanders' FOOD
Single cel multi-omics sequencing om de celbiologie van veroudering te begrijpen KU Leuven
Veroudering is het proces van functioneel verval van onze organen en is een van de belangrijkste risicofactoren voor de meeste humane ziekten. De oorzaken van veroudering zijn nog grotendeels onbekend. Echter, het begrijpen van de celbiologie van dit proces zal belangrijke medische, economische en sociale gevolgen hebben en zal ook de ontwikkeling van antiverouderingsproducten mogelijk maken waarvan de markt naar schatting $ 331,41 miljard ...
FLUOROCODE: een superresolutie optische kaart van DNA. KU Leuven
"There has been an immense investment of time, effort and resources in the development of the technologies that enable DNA sequencing in the past 10 years. Despite the significant advances made, all of the current genomic sequencing technologies suffer from two important shortcomings. Firstly, sample preparation is time-consuming and expensive, and requiring a full day for sample preparation for next-generation sequencing experiments. ...
Nieuwe inzichten in de humane Y-chromosomale variatie voor forensisch DNA verwantschapsonderzoek op basis van uitgebreide stambomen en massive-parallel-sequencing KU Leuven
Forensische DNA-analyse is de gouden standaard in het rechtssysteem om de dader te identificeren via biologische sporen op een plaats delict. Helaas kan dader-identificatie door middel van standaard DNA merkers soms een uitdaging vormen in gemengde man-vrouw DNA-sporen zoals bij seksuele aanranding of moordzaken. Wanneer er sprake is van een mannelijke dader is het mogelijk om het man-specifieke Y-chromosoom (chrY) te genotyperen. Deze ...
Circuleren van celvrij DNA als een alternatieve toegangspoort tot de genetische kenmerken van multipel myeloom en als surrogaatmarker voor ziektelast bij multipel myeloom KU Leuven
Dit onderzoeksproject onderzoekt de onderzoekshypothese dat circulerend celvrij DNA (ccfDNA) kan dienen als een minimaal invasief substraat om op afstand het genoom van de kwaadaardige plasmacellen in multipel myeloom (MM) te onderzoeken. We zullen de detectie van kopieaantalvariaties in ccfDNA uitgebreid valideren, door gepaarde analyse van DNA van gezuiverde plasmacellen door FISH, arrayCGH en low-pass-sequencing door next-generation ...
Cirkulerend tumor DNA als een epigenetische marker van tumor gedrag KU Leuven
Specifieke tumorkenmerken, zoals moleculaire expressie subtypes en hypoxia status, vormen belangrijke voorspellers van patiënt prognose en therapie respons. Bijvoorbeeld, patiënten met HER2-verrijkte borsttumor subtypes hebben een tweevoudig verhoogd risico op sterfte, maar uniek voordeel van Herceptin behandeling. Ook hypoxische tumoren zijn meer vatbaar voor metastase en tonen slechte behandelingsresponsen. De routinematige detectie van ...
Next generation DNA sequentie analyse. Socio-ethische analyse van standardisering- en communicatiepatronen in de rapportering van testresultaten KU Leuven
Next-gen evaluatie van de biodiversiteit en milieu-monitoring van benthische gemeenschappen met behulp van high -throughput DNA metabarcoding Universiteit Gent
Primair doel is om effectief en volledig karakteriseren marine benthische gemeenschappen in het noorden van de Noorse wateren met behulp van high-throughput DNA metabarcoding Nevendoelstellingen 1. holistische en effectieve methoden voor DNA metabarcoding van benthische gemeenschappen op basis van PCR-free high-throughput sequencing 2. bodemdieren analyseren ontwikkelen diversiteit in ongekend detail langs een natuurlijke diversiteit gradiënt ...