Projecten
Integratie van lange read en unieke cell multi-omics sequenering voor de identificatie van genetische variatie in de ziekte van Parkinson KU Leuven
De ontwikkeling van āomics technologieĆ«n is de laatste jaren in een nieuwe stroomversnelling gekomen. We beschikken sinds kort namelijk over de mogelijkheid om unieke lange DNA en RNA moleculen met hoge accuraatheid uit te lezen. Deze lange āreadsā staan ons toe om complete humane genomen de novo te assembleren (wat het humaan genoom project twee decennia kostte) en complexe genomische regios en structurele variatie te bestuderen, hetgeen ...
Kruisbevruchting, zelfbevruchting en vruchtzetregulatie in Europese Peer (Pyrus communis) en hun effect op vruchtkwaliteit KU Leuven
Onvoorspelbare vruchtzetting en lage oogst zijn belangrijke problemen in de commerciƫle perenteelt wereldwijd en zijn vaak het gevolg van een combinatie van het zelf-incompatibiliteitssysteem in peer en slechte (insecten)bestuiving. Het S-RNase-afhankelijke zelf-incompatibiliteitsmechanisme in peer remt de groei van genetisch incompatibele pollenbuizen en voorkomt daardoor bevruchting en vruchtzetting na zelfbestuiving. Om een ...
MAGE ā Modelleren van Allelische GenExpressie bij gezondheid en ziekte Universiteit Gent
De studie van de expressie van individuele allelen zou ons veel over de moleculaire oorzaken van ziektes zoals kanker kunnen leren, maar bestaande methodes zijn onbetaalbaar of geven maar partiƫle informatie. In dit project zullen we een nieuwe, goedkopere en completere methodologie ontwikkelen, gebaseerd op concepten van populatiegenetica en statistische modellering, en de meerwaarde ervan aantonen in een kankerstudie.
Bestuderen van tumor heterogeniteit en evolutie aan de hand van singel-moleculen multi-omics KU Leuven
Kanker is voornamelijk een genetische ziekte, die kan ontstaan door somatische mutaties in cellen doorheen onze levenscyclus. Het grote deel van deze mutaties zijn eerder onschuldig, toch kunnen sommige mutaties aanleiding geven tot typische halfmakers of kanker. Dit kan leiden dat deze cellen een competitie voordeel generen ten opzichte van de aanliggende cellen, leidend tot clonale expansie. Deze clonale expansie kan gevormd worden door ...
Studie van gistinvertasen voor het wijzigen van fructangehalte in brood KU Leuven
Saccharomyces cerevisiae invertase (ScInv) is een Ī²-fructofuranosidase dat wordt gecodeerd door verschillende, nauw verwante SUC-genen en wordt ingedeeld in de familie 32 van de glycoside hydrolasen. ScInv geeft de voorkeur aan sucrose als substraat, maar kan daarnaast ook raffinose, fructo-oligosacchariden (FOS) en korte keten fructanen hydrolyseren. Invertase, geproduceerd door de bakkersgist, speelt een belangrijke rol tijdens de ...
Genoom en transcriptoom editing met CRISPR/Cas als precisie therapie voor de ziekte van Charcot-Marie-Tooth type 2L. Universiteit Antwerpen
Het gehumaniseerd dfna9-muismodel als een nieuwe aanpak om weefselspecifieke en bloedgebaseerde bio-assays te identificeren die de menselijke dfna9-pathofysiologie weerspiegelen en crispr/cas-systemen te testen om gehoorverlies te voorkomen. Universiteit Antwerpen
Ontrafelen van de rol van APOE in astrocyten en microglia bij de ziekte van Alzheimer KU Leuven
Polymorfisme in het APOE-gen is de sterkste genetische risicofactor voor de ziekte van Alzheimer. APOE heeft 3 allelische varianten met verschillende risicoprofielen voor de ziekte - APOE2 is het beschermende allel, APOE3 is het risicoallel en APOE4 is het schadelijke allel. De ApoE4 isoform van het eiwit staat bekend als cruciaal voor amyloĆÆde plaque-pathologie in AD, naast het spelen van een rol in neuro-inflammatie, endolysosomale ...
Onderzoek naar de genetische oorzaak van ernstige autoinflammatoire ziekten KU Leuven
Het domein van aangeboren stoornissen van het immuunsysteem evolueert snel dankzij de introductie van next generation sequencing (NGS) in 2010, de nauwe samenwerking tussen clinici en onderzoekers, de beschikbaarheid van nieuwe hulpmiddelen en modelorganismen en de identificatie van nieuwe klinische fenotypes. In het verleden bleef de classificatie van deze groep aandoeningen beperkt tot een algemeen verhoogde gevoeligheid aan infecties. Dit ...