Organisatie
Laboratorium voor Computationele Biologie (VIB-KU Leuven)
Division
Het onderzoek in het Laboratorium voor Computational Biology is gericht op gen- en genoom regulatie, met toepassingen in Drosophila en kanker, en op 'integrative genomics', de ontwikkeling van computationele methoden voor genomische data integratie en analyse van 'next-generation sequence data'.
Huidige onderzoekers
1 - 10 of 21 results
- Stein Aerts (Verantwoordelijke)
- Darina Abaffyová (Lid)
- Stein Aerts (Lid)
- Sara Aibar Santos (Lid)
- Cas Blaauw (Lid)
- Carmen Bravo González-Blas (Lid)
- Florian De Rop (Lid)
- Seppe De Winter (Lid)
- Hannah Dickmänken (Lid)
- Sam Dieltiens (Lid)
Projecten
1 - 10 of 64
- Genregulatie begrijpen in een heel dier: Van het bouwen van een regulatie-atlas tot het decoderen van genregulatie met deep learningVanaf10 jan 2024 → HedenFinanciering: Eigen Middelen zoals patrimonium, inschrijvingsgelden, giften, ....
- SpaceTimeOmics: combinatie van hogedoorvoer spatial omics met AI om generegulatie te modeleren in een organisme doorheen de tijdVanaf1 jan 2024 → HedenFinanciering: FWO Onderzoeksproject (incl. WEAVE projecten)
- Interpretatie van genomische regulatorische variatie in de menselijke hersenen en de ziekte van Parkinson, door integratie van deep learning en single-cell multi-omicsVanaf1 okt 2023 → HedenFinanciering: FWO junior postdoctoraal mandaat
- Deep learning gebaseerd synthetisch ontwerp en massaal parallelle reporterassays om celtype- specifieke enhancer te karakteriseren en te benuttenVanaf1 okt 2023 → HedenFinanciering: Eigen Middelen zoals patrimonium, inschrijvingsgelden, giften, ....
- Enhancer-AI: AI-gestuurde modellering en ontwerp van celtype-specifieke versterkers voor gentherapieVanaf1 okt 2023 → HedenFinanciering: FWO Strategisch Basisonderzoek (SBO)
- Deep learning oplossingen voor het ontcijferen van genregulatie in het menselijk breinVanaf7 mrt 2023 → HedenFinanciering: FWO Strategische Onderzoeksbeurs
- De rol van door smORF gecodeerde polypeptiden bij lagere bierfermentatieVanaf1 jan 2023 → HedenFinanciering: FWO Onderzoeksproject (incl. WEAVE projecten)
- Toepassingen van deep learning voor kankergenomicaVanaf1 jan 2023 → HedenFinanciering: Eigen Middelen zoals patrimonium, inschrijvingsgelden, giften, ....
- Evolutie van de genomische regulatorische code die ten grondslag ligt aan neuronale diversiteitVanaf1 okt 2022 → HedenFinanciering: Eigen Middelen zoals patrimonium, inschrijvingsgelden, giften, ....
- SymBioSys: Analyse van de genomische heterogeneïteit via de computationele analyse van lange DNA fragmentenVanaf1 okt 2022 → HedenFinanciering: BOF - projecten
Publicaties
1 - 10 van 177
- HIGH-THROUGHPUT SEQUENCING OF THE HUMAN HEPATIC PROGENITOR CELL NICHE REVEALS DIFFERENT SIGNALLING PATHWAYS DEPENDING ON THE UNDERLYING CHRONIC LIVER DISEASE(2015)
Auteurs: Olivier Govaere, Jasper Wouters, Wouter Van Delm, R van Eijsden, An Ceulemans, Werner Van Steenbergen, Diethard Monbaliu, Frederik Nevens, Tania Roskams
Pagina's: S239 - S239 - Combined Proteomics and Transcriptomics Identifies Carboxypeptidase B1 and Nuclear Factor κB (NF-κB) Associated Proteins as Putative Biomarkers of Metastasis in Low Grade Breast Cancer(2015)
Auteurs: Hana Imrichova
Pagina's: 1814 - 1830 - The protein phosphatase 2A regulatory subunit PR70 is a gonosomal melanoma tumor suppressor gene(2016)
Auteurs: Jasper Wouters, Joost van den Oord
- Low expression of pro-apoptotic proteins Bax, Bak and Smac indicates prolonged progression-free survival in chemotherapy-treated metastatic melanoma(2020)
Auteurs: Jasper Wouters, Joost van den Oord
- Cancer stem cells in cutaneous melanoma(2009)
Auteurs: Jasper Wouters, Joost van den Oord, Hugo Vankelecom
Pagina's: 225 - 235 - Evidence for DNA-Binding Domain-Ligand-Binding Domain Communications in the Androgen Receptor(2012)
Auteurs: Christine Helsen, Vanessa Dubois, Annelien Verfaillie, Marc De Maeyer, Frank Claessens
Pagina's: 3033 - 3043 - CD45 antigen negativity in T-lineage ALL correlates with PTPRC mutation and sensitivity to a selective JAK inhibitor(2015)
Auteurs: Stein Aerts, Ellen Geerdens, Jan Cools
Pagina's: 884 - 7 - Plasma cells in primary melanoma. Prognostic significance and possible role of IgA(2016)
Auteurs: Francesca Bosisio, Jasper Wouters, Marguerite Stas, Joost van den Oord
Pagina's: 347 - 58 - BNIP3 promotes HIF-1α-driven melanoma growth by curbing intracellular iron homeostasis(2021)
Auteurs: Matteo Rossi, Chris Van den Haute, Maria Livia Sassano, Abhishek Garg, Francesca Bosisio, Jasper Wouters, Peter Vangheluwe, Wim Annaert, Johan Swinnen, Joost van den Oord, et al.
- A Functional In Situ Approach to TILs in Melanoma: A Critique on the Current Morphological Classification(2016)
Auteurs: Francesca Bosisio, Jasper Wouters, Nathalie Volders, Marguerite Stas, Joost van den Oord
Pagina's: 126A - 126A