Onderzoeker
Francisco Avila Cobos
- Trefwoorden:Niet-coderend RNA, Transcriptomics, Data Mining, Bio-informatica, vloeibare biopsie, biostatistiek
- Disciplines:Computationele transcriptomics en epigenomics
Affiliaties
- Vakgroep Biomoleculaire Geneeskunde (Departement)
Lid
Vanaf1 okt 2018 → 31 dec 2023 - Vakgroep Pediatrie en genetica (Departement)
Lid
Vanaf1 okt 2014 → 30 sep 2018
Projecten
1 - 2 of 2
- Implementatie van een longitudinaal meerdere omics voorspellingsmodel voor respons op immunologische controle punt remmenVanaf1 okt 2021 → 28 feb 2022Financiering: BOF - postdoctorale mandaten
- Ontwikkeling van een data-analyse pijplijn voor drug doelwit identificatie uit het circulerend transcriptoom van longtumor patiënten.Vanaf1 jan 2017 → 15 feb 2020Financiering: BOF - Nieuwe Onderzoeksinitiatieven
Publicaties
11 - 20 van 40
- Benchmarking of cell type deconvolution pipelines for transcriptomics data(2020)
Auteurs: Francisco Avila Cobos, José Alquicira-Hernandez, Joseph E. Powell, Pieter Mestdagh
- The role of miR-155 in cigarette smoke-induced pulmonary inflammation and COPD(2020)
Auteurs: Hannelore Van Eeckhoutte, Francisco Avila Cobos, Fien Verhamme, Sharen Provoost, STIJN VERLEDEN, Pieter Mestdagh
Pagina's: 423 - 436 - A comprehensive custom panel evaluation for routine hereditary cancer testing : improving the yield of germline mutation detection(2020)
Auteurs: C Velázquez, E Lastra, Francisco Avila Cobos, L Abella, V de la Cruz, BA Hernando, L Hernández, N Martínez, M Infante, M Durán
- Dramatic differences in RNA purification kit performance in the extracellular RNA quality control study : important considerations for liquid biopsies(2019)
Auteurs: Francisco Avila Cobos, Carolina Fierro, Hetty Helsmoortel, An Hendrix, Eva Hulstaert, Scott Kuersten, Pieter Mestdagh, Nele Nijs, Justine Nuytens, Annouck Philippron, et al.
Aantal pagina's: 1 - Benchmarking the impact of data transformation, pre-processing and choice of method in the computational deconvolution of transcriptomics data(2019)
Auteurs: Francisco Avila Cobos, José Alquicira-Hernandez, Jo Vandesompele, Joseph Powell, Pieter Mestdagh, Katleen De Preter
Aantal pagina's: 1 - Long noncoding RNA expression profiling in cancer : challenges and opportunities(2019)
Auteurs: Lucia Lorenzi, Francisco Avila Cobos, Hetty Helsmoortel, Karen Verboom, Pieter Mestdagh
Pagina's: 191 - 199 - Zipper plot : visualizing transcriptional activity of genomic regions(2018)
Auteurs: Francisco Avila Cobos, Jasper Anckaert, Dries Rombaut, Pieter Mestdagh
Aantal pagina's: 1 - The extracellular RNA quality control (exRNAQC) study : controlling pre-analytical variables of RNA sequencing in blood-based precision medicine(2018)
Auteurs: Francisco Avila Cobos, Carolina Fierro, Hetty Helsmoortel, An Hendrix, Eva Hulstaert, Pieter Mestdagh, Annouck Philippron, Thomas Piofczyk, Ruben Van Paemel, Kimberly Verniers
Aantal pagina's: 1 - A comprehensive inventory of TLX1 controlled long non-coding RNAs in T-cell acute lymphoblastic leukemia through polyA+ and total RNA sequencing(2018)
Auteurs: Karen Verboom, Wouter Van Loocke, Bieke Decaesteker, Francisco Avila Cobos, Simon Bornschein, Charles E de Bock, Zeynep Kalender Atak, Emmanuelle Clappier, Stein Aerts, Jan Cools, et al.
Pagina's: E585 - E589 - The role of microRNA-155 in cigarette smoke-induced inflammation(2018)Volume: 52
Auteurs: Pieter Mestdagh, Francisco Avila Cobos, Evy Blomme, Fien Verhamme, Sharen Provoost, Tania Maes, Guy Joos, Guy Brusselle, Ken Bracke
Pagina's: 1824 - 1825