Projecten
Implementatie van ratiometrische time-lapse fluorescentiemicroscopie in de studie naar metabolische veranderingen in Escherichia coli O157:H7 cellen gestresseerd door hoge hydrostatische druk KU Leuven
In dit voorstel willen we daarom deze nieuwe generatie ratiometrische fluorescerende intracellulaire biosensoren voor redox, pH, ATP en cAMP (evenals de technische benadering voor monitoring van deze sensoren) implementeren, valideren en exploiteren om resistentie, reanimatie en inactivatie dynamica binnen hoog-hydrostatische drukgestreste populaties van de beruchte E. coli O157: H7 via voedsel overgedragen pathogeen bij singe-cel resolutie ...
Bacteriële invasie-ecologie in microbiële biofilms vastgelegd met time-lapse microscopie. De bacteriële strijd verfilmd. KU Leuven
Dit project gebruikt timelapse imaging om het invasieproces in microbiële biofilms te visualiseren om zowel het belang van selectie als dispersie tijdens invasie te testen.
Energie transfer van dendritische mitochondria als drijvende kracht achter succesvolle axonale regeneratie? KU Leuven
Het behandelen van neurodegeneratieve aandoeningen zoals de ziekte van Alzheimer, de ziekte van Parkinson, multiple sclerose en glaucoom, evenals zenuwschade na hersentrauma, vormt een grote medische en sociaaleconomische uitdaging voor onze vergrijzende samenleving. Deze momenteel ongeneeslijke aandoeningen veroorzaken progressieve degeneratie van zenuwcellen en onomkeerbare beperkingen in het centrale zenuwstelsel (CZS) van volwassen ...
Karakterisering van een thermofiele acidogene microbiële gemeenschap die organisch afval afbreekt met productie van de hoogwaardige chemicalie capronzuur door gebruik te maken van een combinatie van “culturomics” en meta-omica KU Leuven
Voorgestelde schets van het proefschrift: Dit onderzoek beoogt de ontwikkeling van een biologisch model dat de metabole interacties in de biologische anaerobe afval-verteringsreactor C1 van het MELiSSA-systeem verklaart. Dit systeem, gebaseerd op een ecosysteem van meren, richt zich op het recyclen van afval door voornamelijk microbiële reacties, tijdens lange termijn ruimtemissies. Vier hoofdactiviteiten worden uitgevoerd om een gevalideerd ...
Talen en methoden voor vraaggeörienteerde datamining in de bio-informatica KU Leuven
Recente technologische ontwikkelingen stellen microbiologen er toe in staat om high-throughput experimenten uit te voeren op cel niveau, door bijvoorbeeld gebruik te maken van time-lapse microscopie. Zulke experimenten produceren een enorme hoeveelheid moeilijk te analyseren gestructureerde data. Datamining technieken, die trachten kennis te halen uit data, kunnen hierbij helpen. Het is echter niet altijd triviaal om bestaande technieken toe ...
Ontwikkeling van het CellPhInDER platform en zijn toepassing in de fysiologische dissectie van proteïne aggregatie in bacteriën. KU Leuven
De invloed van temperatuur op de snelheid van ontwikkeling van aquatische ectothermen KU Leuven
Levende organismen worden voortdurend beïnvloed door hun omgeving. Interacties tussen embryo en omgeving zijn bijzonder belangrijk omdat elke verstoring tijdens deze periode kan doorwerken in latere ontwikkelingsstadia. Embryo's zijn vaak passief afhankelijk van hun omgeving en zelfs een subtiele aantasting van de omgeving tijdens een belangrijk ontwikkelingsstadium kan een grote impact hebben op de levensvatbaarheid van het embryo en op de ...
Data-gedreven ontdekking van celcyclusmodellen KU Leuven
Het doel van dit project is het onderzoeken en blootleggen van onderliggende modellen die in staat zijn de celcyclus te beschrijven. Hiertoe worden celvrije extracten van kikkereieren gebruikt en verstoord terwijl ze geobserveerd worden met time-lapse fluorescentiemicroscopie. De aldus gecreëerde data die spatiotemporele dynamica bevatten, worden geanalyseerd met recent ontwikkelde data-gedreven technieken voor machinaal leren. Deze ...
Evolutionaire strategieën voor het afstellen van de trade-off tussen cellulaire resistentie en groei in Escherichia coli. KU Leuven
Hoewel de aggregatie van proteïnen in bacteriële cellen doorgaans wordt beschouwd als een nadelig fenomeen, heeft onze onderzoeksgroep indicaties dat de aanwezigheid van proteïne-aggregaten ook positieve effecten kan sorteren op de resistentie van micro-organismen. Onze preliminaire resultaten suggereren dat natuurlijke selectie kan kapitaliseren op mutaties die de hoeveelheid misvouwen eiwitten in de cel verhogen en daarmee een gelijktijdige ...