PACBIO: en derde generatie sequencing platform met Single Molecule Real Time technologie (SMRT) (PACBIO)

Het PacBio RS-systeem is een belangrijke toevoeging in de instrumentatie die nodig is om grote wetenschappelijke vragen in genomics aan te pakken. De PacBio RS is een derde generatie sequencing platform met Single Molecule Real Time technologie (SMRT). De sequencer introduceert een aantal nieuwe functies voor sequencing die complementair zijn met de huidige (tweede generatie) sequencers die beschikbaar zijn in de Genomics Core in Leuven en in andere faciliteiten in Vlaanderen. Het is het eerste instrument om DNA in realtime te detecteren. Bovendien is er geen versterkingsstap nodig tijdens het bereiden van de monsters, omdat elke sequentielezing afgeleid wordt uit een enkel DNA molecuul (single molecule sequencing). Een bijkomend voordeel is de langleeslengte van meer dan 1000 basisparen, die momenteel alleen kan worden bereikt met conventionele Sanger-gebaseerde sequencing, maar niet door andere high-throughput instrumenten. Deze lange lezingen leiden tot een nieuwe kwaliteit in de sequentiedata voor veel toepassingen. Het systeem zorgt voor directe RNA en epigenome sequencing. Ten slotte gaan de toepassingsdomeinen van PacBio RS goed verder dan sequencing, omdat het systeem de capaciteit heeft om de kinetiek van DNA-eiwitinteracties te meten.