Voorspellende genetische markers bij gynaecologische kankers: hoe gerichte therapie verbeteren.

De ontwikkeling van gerichte therapieën opende een nieuw tijdperk in de behandeling van gynaecologische kankers. Er is echter weinig bekend over de ideale positie en timing in de behandelingsstrategie en welke patiënten in het bijzonder baat zullen hebben bij behandelingen zoals poly (ADP-ribose) polymerase remmers (PARPi) en immuun checkpoint blokkade (ICB). Het doel van dit project is om (epi-)genetische markers te vinden die de respons op deze behandelingen voorspellen. 1) PARPi bleek een succesvolle behandeling te zijn bij BRCA gemuteerde ovariumkanker. Echter, andere functionele defecten in de homologe recombinatie DNA-herstelroute lijken een goede respons op PARPi te veroorzaken. Het eerste doel van dit project is het ontwikkelen en valideren van een in-huis ontwikkelde homologous recombination repair deficiency (HRD) test die de respons op PARPi in al dan niet BRCA gemuteerde ovariumkanker kan voorspellen. 2) De huidige predictieve markers die in de klinische praktijk worden gebruikt, lijken niet betrouwbaar genoeg om de respons op ICB in zowel ovarium- als cervix kanker te voorspellen. Om een blauwdruk te maken van het ecosysteem van de tumor op single cell resolutie, zullen we single cell RNA-sequencing en single cell T-cell receptor sequencing uitvoeren, en deze evalueren in het licht van de klinische respons van onze patiënten. Verder willen we, naast de tumor-microomgeving, de rol van methylering in de resistentie van cervixcarcinomen tegen ICB analyseren.