Karakterisering van tandem herhalingen in het menselijk genoom en hun rol in ziekten

Tandem herhalingen zijn korte DNA-sequenties die herhaald worden van kop tot staart. Dergelijke herhalingen komen in grote aantallen in alle genomen voor, maar ze werden traditioneel beschouwd als niet-functioneel "junk" DNA en worden daarom meestal genegeerd. Echter, eerder onderzoek in gistcellen toont aan dat tandem herhalingen vaak voorkomen in coderende en regulerende sequenties. De herhalingen tonen een mutatiefrequentie die 10 tot 10.000 maal hoger is dan de rest van het genoom. Deze frequente mutaties veranderen de functie en / of expressie van genen, waardoor organismen sneller aanpassen aan nieuwe omgevingen. Derhalve kunnen herhalingen een algemeen mechanisme vormen voor organismen om variabiliteit in bepaalde gebieden van het genoom te genereren, terwijl andere gebieden stabiel gehouden worden. Vergelijkbaar met andere genomen, is het menselijke genoom bezaaid met tandem herhalingen, waarvan velen in de coderende gebieden van genen. We stellen voor te onderzoeken hoe variabel deze herhalingen zijn tussen verschillende nauw verwante individuen, alsmede tussen weefsels in een individu. Ten derde zullen we onderzoeken of bepaalde variabele herhalingen in het menselijk genoom kunnen worden gekoppeld aan specifieke fenotypes of ziekten.