< Terug naar vorige pagina
Project
Direct uitlezen van lange individuele DNA moleculen: grensverleggend biologisch en medisch onderzoek.
Dit project heeft als doel de huidige sequentie
infrastructuur, beschikbaar aan de Universiteit Antwerpen
(UA), naar een volgend niveau te tillen door middel van de
aankoop van een derde generatie sequentie (3GS) platform.
Het toppunt van deze derde generatie sequencers, de
PacBio Sequel, maakt gebruik van het natuurlijk
replicatieproces om individuele DNA moleculen uit te lezen
tijdens het replicatieproces. 3GS opent op die manier
nieuwe deuren voor sequentie-gebaseerd onderzoek voor
dit consortium dat bestaat uit 14 UA onderzoeksgroepen uit
verschillende vakgebieden zoals geneeskunde, biologie en
bioinformatica. Bijkomend hebben een aantal derde
partijen toegezegd deze technologie te willen gebruiken
voor hun lopende en toekomstige onderzoeksprojecten.
Binnen dit consortium zal 3GS gebruikt worden om
prokaryote en eukaryote genomen te sequeneren, inclusief
moeilijk te sequeneren deelgebieden, nieuwe genen en
mutaties te identificeren in diverse zeldzame Mendeliaanse
stoornissen, epigenetische modificaties te identificeren om
aldus een beter begrip te krijgen van biologische processen
zoals genexpressie en gastheer-pathogeen interacties, het
microbioom van de mens, muis en omgeving in kaart te
brengen en dit in relatie met bepaalde ziektebeelden en
verschillende stresfactoren uit de omgeving, nieuwe
preventiestrategieën te ontwikkelen voor
infectiegeassocieerde ziekten met het oog op betere
doelwitten voor medicijnen. De analyse van de grote
hoeveelheden genoom en transcriptoom data van de verschillende onderzoeksgroepen zal gecoördineerd worden door de UZA/UA bioinformatica groep Biomina
Datum:1 mei 2018 → 30 apr 2021
Trefwoorden:GENOMICA, TRANSCRIPTOMICS, BIO-INFORMATICA
Disciplines:Scientific computing, Bio-informatica en computationele biologie, Maatschappelijke gezondheidszorg, Publieke medische diensten
Project type:Samenwerkingsproject