Methyloom analyse van celvrij DNA: nieuwe toepassingen

Celvrij DNA (cfDNA) methylatie-analyse wordt in toenemende mate toegepast voor niet-invasieve screening, diagnose en monitoring van verscheidene fysiologische en pathologische aandoeningen. Ik stel voor deze toepassingen uit te breiden door me te richten op drie groepen; gezonde personen, zwangere vrouwen en tweelingen. Eerst zal ik intra-individuele variatie in cfDNA methylering bestuderen aan de hand van longitudinale en leeftijdsspecifieke methyloom data van gezonde personen, hetgeen inzicht verschaft in de fysiologische variabiliteit en dynamiek van cfDNA. Daarnaast heeft het gastlaboratorium een cfDNA methylatie test ontwikkeld om vroege pre-eclampsie (PE) in het eerste trimester van de zwangerschap op te sporen. Ik zal nagaan of deze test ook late PE kan detecteren. Voorts beoog ik een cfDNA methylatie-gebaseerde test te ontwikkelen om vanishing twins op te sporen. Dit zal niet enkel fundamentele kennis opleveren, maar ook interpretatie van niet-invasieve prenatale tests verbeteren. Tenslotte zal ik nagaan of vanishing twins een specifiek DNA methylatie patroon dragen en verifiëren of dat patroon bijdraagt tot het ontrafelen van de etiologie van oculo-auriculo-vertebrale-spectrum. Verwachte voordelen omvatten vroegtijdige opsporing van pre-eclampsie en vanishing twins, waardoor kosten voor de gezondheidszorg worden gedrukt. Verder zal het in kaart brengen van variatie in het cfDNA methyloom waardevolle informatie opleveren voor screening en gepersonaliseerde monitoring.