Een microfluidisch platform om het therapeutisch potentieel van geëngineerde lasso peptiden te screenen

Ribosomaal gesynthetiseerde en post-translationeel gemodificeerde peptiden (RiPPs) zijn een snel groeiende klasse van chemisch en structureel diverse bacteriële natuurlijke producten. Vele RiPPs vertonen belangrijke therapeutische activiteiten, zoals antibiotische, antifungale, insecticide, immunomodulerende en antikanker activiteiten. De enzymen die RiPPs aanmaken zijn tolerant naar aminozuur mutaties. In combinatie met een toename van methoden om meerdere mutaties te introduceren, opent dit de deur naar het genereren van banken van RiPP-varianten die kunnen worden gescreend op verbeterde farmaceutische eigenschappen. Er is op dit moment geen geschikt screeningsplatform dat deze hoeveelheden varianten aankan. Wij geloven dat een op druppels gebaseerd microfluïdisch platform de ideale technologie is om grote aantallen aangepaste RiPP-varianten te analyseren. Een microfluïdische druppel is de kleinst denkbare bioreactor; het is de ultieme miniaturisatie van een microtiterplaat. Dit laat ons toe om assays uit te voeren aan een analysesnelheid van 2000 varianten per seconde. In dit project willen we een op druppels gebaseerd microfluïdisch platform ontwikkelen om banken van aangepaste RiPPs te screenen op varianten met nieuwe biologische activiteiten die kunnen worden gebruikt voor therapeutische toepassingen. Door mijn ervaring met proteïne engineering en de ontwikkeling van microfluïdische platformen ben ik ervan overtuigd dat ik de beste kandidaat ben voor dit project.