Mycobacterium tuberculosis transmissiedynamiek bij de universiteitsstudenten in Ethiopië: een onderzoek d.m.v. compleet genoom sequencen.

Waar tbc voorkomt in situaties met hoge incidentie zoals Ethiopië, is de overdracht ervan niet goed bestudeerd, omdat traditionele onderzoeksmethoden moeite hebben om het grote aantal transmissieketens in deze scenarious te onderscheiden vanwege onvoldoende resolutie. Whole Genome Sequencing (WGS) is een nieuwe krachtige technologie voor het karakteriseren van bacteriële genomen en is met succes gebruikt om M. tuberculosis-isolaten geassocieerd met TB-uitbraken te onderzoeken en om de transmissielink tussen de index- en contactgevallen vast te stellen. WGS heeft ook het potentieel om broncasussen te identificeren en karakteriseren die bijzonder effectief zijn in het genereren van secundaire gevallen. We zullen WGS-sequentiemethoden en nieuwe fylogenetische benaderingen gebruiken om de dynamiek en de locatie van tbc-overdracht in de Ethiopische universitaire omgeving te bestuderen. We zullen ook de geïdentificeerde transmissieclusters karakteriseren door middel van gecorreleerde sociale en demografische factoren. Een beter begrip van hotspot-transmissielocaties, en methoden om de broncasus daarin te identificeren en te karakteriseren, zijn dringend nodig om tuberculosebestrijding in de Ethiopische universitaire setting te verbeteren.

Trefwoorden:GENETISCHE EPIDEMIOLOGIE

Disciplines:Bio-informatica van ziekten, Epidemiologie