Ontcijfering van de rol van twee LysR-type transcriptieregulaors van Pseudomonas aeruginosa, OxyR en PA4203. (FWOAL537)

LysR-type transcriptieregulators (LTTR) komen voor in alle bacteriële genomen waar zij de grootste familie van bacteriële regulators vorman. LTTRs zijn gekend als activators van een enkel gen of operon maar ook van verafgelegen genen en kunnen een meer globale rol spelen in transcriptieregulatie. In het genoom van het opportunistisch pathogeen Pseudomonas aeruginosa PAO1 coderen meer dan 120 genen voor mogelijke LysR-type regulators waaronder twee, OxyR en PA4203 in dit project worden bestudeerd. Naast een cruciale rol in de opregulatie van de verdediging tegen oxidatieve stress draagt OxyR ook bij tot de virulentie van P. aeruginosa. Het PA4203 gen ligt stroomopwaarts van PA4204, dat voor een periplasmatische gluconolactonase codeert. Een deletiemutant van het PA4203 ge,n vertoont interessante fenotypes zoals een verhoogde swarming en swimming motiliteit, en een verhoogde autolyse, die gepaard gaat met een afscheiden van DNA in het groeimedium. Wij stellen voor om een beter onzicht te verwerven in de uitgestrektheid van de OxyR en PA4203 regulaons, de ligand(en) van PA4203 te identificeren, de interacties van beide regulators met hun respectievelijke targets te analyseren en hun moleculair werkingsmechanisme te bepalen.

Trefwoorden:Applied Biology

Disciplines:Biologische wetenschappen