Naar een microbieel netwerkinferentie en analyseplatform

Microbiële netwerkinferentie voorspelt koppelingen tussen microbiële taxa van herhaalde metingen en construeert daarbij netwerke van met elkaar verbonden taxa. Met de recente toename van het aantal sequeneringsprojecten is er ook een toegenomen interesse om netwerken te bouwen die toelaten om de microbiële gemeenschapsstructuur te onderzoeken. Ondanks het grote aantal beschikbare microbiële netwerkinferentie toepassingen is er actueel geen toepassing gewijd aan de analyse en interpretatie van zulke netwerken. In het algemeen spenderen onderzoekers meer tijd aan de analyse dan aan de bouw van microbiële netwerken om ecologische inzichten uit deze netwerken te verkrijgen: data, afkomstig van verschillende bronnen, worden hierbij manueel geïntegreerd om zin te geven aan de voorspelde koppelingen. We stellen daarom voor om een microbieel netwerkanalyseplatform te ontwikkelen dat deze taak zoveel mogelijk zal automatiseren.

Trefwoorden:meat products

Disciplines:Microbiologie, Systeembiologie, Laboratoriumgeneeskunde