Projecten
Centrum voor whole genomen sequencing van Mycobacterium tuberculosis Universiteit Antwerpen
experimentele verkenning van de onzekere weg van genoom duplicatie naar evolutionair succes Universiteit Gent
Polyploidization of whole genome duplication (WGD), is een wijdverspreid fenomeen onder
Eukaryoten, maar komt vooral veel voor in de plantlijn. De extra genoomkopie kan een weg openen
tot evolutionair succes door genetisch materiaal te leveren dat vrij is om nieuwe functionaliteiten te ontwikkelen.
Niettemin wordt WGD over het algemeen niet goed verdragen als gevolg van latere wijzigingen in de celgeometrie en ...
Ontwikkeling van nieuwe methoden voor het voorspellen van het drug resistentie fenotype van Mycobacterium tuberculosis varianten. Universiteit Antwerpen
Ontwikkeling van een nieuwe methode voor single-cell hele-genoom amplificaties voor het bestuderen van kanker heterogeniteit. KU Leuven
Alle cellen in een menselijk lichaam ontstaan uit één enkele cel, de bevruchtte eicel of zygote. Tijdens verdere ontwikkeling delen de cellen, nemen ze beslissingen over hun lotsbestemming en schakelen ze tussen verschillende celtypen en hun functionele status. Bij elke celdeling wordt de genetische code gekopieerd en doorgegeven aan de dochtercellen. Hoewel dit onder strikte controle staat, gebeuren er ook fouten. In de meeste gevallen ...
Verbeterde modellering en genetische studies voor overerfbare bloedplaatjes defecten KU Leuven
Aangeboren plaatjesaandoeningen zijn uiterst heterogeen, met genetische varianten in 63 genen, en worden gekenmerkt door bloedingen of maken deel uit van complexe syndromen. Verschillende genen werden ontdekt door whole exome/genome sequencing (WES/WGS) maar vaak is hun rol in bloedplaatjesvorming of -functie niet geweten door een gebrek aan dier- of efficiente cel-gebaseerde modellen. Momenteel kunnen multigen panel testen een diagnose ...
ERA NET ANIHWA: Bacteriofagen als alternatief voor antimicrobiële behandeling van boviene mastitis veroorzaakt door methicilline-resistente Staphylococcus Aureus (MRSA) Universiteit Gent
Antimicrobiële behandeling van mastitis heeft geleid tot de selectie van resistente stafylokokken, waaronder de methicilline-resistente S. aureus (MRSA) zijn de meest bestudeerde degenen. Toch MR is ook beschreven voor niet-S. aureus (NSA) soorten. Bovine veterinaire MR (N) SA vertegenwoordigt niet alleen een probleem bij de behandeling van mastitis, maar ook een potentieel gevaar voor de volksgezondheid via het inter-Staphylococcus ...
Monogene auto-inflammatoire aandoeningen: oppuntstelling van de identificatie en validatie van nieuwe varianten en exploratie naar de fenotypische variabiliteit van ziekte. KU Leuven
Monogene AID's zijn een groep zeldzame aandoeningen die veroorzaakt worden door ongepaste activering of gebrek aan regulatie van het aangeboren immuunsysteem. De toename in het aantal AID's die in het afgelopen decennium werden beschreven bracht inzicht in verschillende pathways van het immuunsysteem met een rol in zowel gezondheid als ziekte. Deze diagnoses werden gesteld met behulp van next generation sequencing, namelijk whole exome en ...
Hoe Zeesla bloeit, de genetische oorzaken achter Ulva bloeivorming Universiteit Gent
Ruimtelijke variatie in omgeving veroorzaakt lokale adaptie bij populaties van verschillende soorten. Ons begrip van moleculaire processen die aan de basis liggen van adaptatie is vrij schaars en de identificatie van causale mutaties blijft moeilijk. Deze studie wil de genetische variatie bestuderen van populaties van het groen zeewier Zeesla (Ulva) die grote bloeien veroorzaken (‘green tides’). We zullen een F2 populatie maken door vier ...
Intra-host evolutie van Lassa virus in acute infectie en virus persistentie KU Leuven
Lassa virus (LASV) is een endemisch virus in West Afrika dat elk jaar honderdduizenden infecteert. Mensen worden hoofdzakelijk besmet door contact met knaagdieren van het genus Mastomys die virus uitscheiden via urine en faeces. Ongeveer 80% van de infecties blijven asymptomatisch, maar 1 op 5 LASV infecties resulteren in een acute virale hemorragische ziekte. Er bestaat geen effectieve behandeling of vaccin en er is weinig gekend omtrent ...