Projecten
S100A8/A9 proteines, HMGB1 en hun gemeenschappelijke receptoren in de pathofysiologie van chronische luchtwegaandoeningen Universiteit Gent
Chronische rhinosinusitis is een heterogene groep van chornische aandoeningen van de bovenste luchtwegen die een hoge co-morbiditeit met astma vertonen. Er is evidentie dat S100A8/A9 proteines en HMGB1 een modulerende rol kunnen vervullen gedurende inflammatie door regulatie van inflammatoire cellen via RAGE en TLR'en. Met het porject beogen we een karakterisering van de interactieve betrokkenheid van deze moleculen bij de persistentie van ...
Analyse van proteïne- en nucleïnzuurcomplexen met behulp van niet-denaturerende ionenmobiliteits massaspectrometrie. Universiteit Antwerpen
Computationele studie van proteine-ligand interacties: Casus van SERCA en biofilm gerelateerde proteïnen KU Leuven
Het doel van dit doctoraatsproject was om computationele technieken zoals moleculaire docking en MD simulaties te gebruiken zodat een gedetailleerd inzicht kan bekomen worden in de structurele basis van specifieke proteïne-ligand complexen. Deze methoden werden toegepast op twee belangrijke case studies: een familie van Ca2+ transporters genaamd Sarco-/endoplasmatisch reticulum Ca2+-ATPase (SERCA), dat een rol speelt in hartfalen, en ...
Nieuwe inzichten in de interactie tussen ryanodine receptoren en Bcl-2 proteïnen. KU Leuven
Intracellulaire Ca2+ signalisatie is betrokken bij een groot aantal cellulaire processen gaande van cel proliferatie, cel overleving tot autofagie en celdood. Cellen brengen een zeer uitgebreid aantal proteïnen tot expressie om intracellulaire Ca2+ signalenen te controleren. De ryanodine receptor (RyR) proteïne familie is een familie van Ca2+ kanalen gelokaliseerd in de membranen van het sarco/endoplasmatisch reticulum van verscheidene ...
Lanthanide houdende polyoxometalaat complexen als regioselectieve reagentia voor hydrolyse van proteïnen. KU Leuven
Onderzoek van celtype-specifieke defecten in de kwaliteitscontrole van proteïnen doorheen het genetische landschap van de ziekte van Parkinson. KU Leuven
Inzicht in de reactiviteit en moleculaire interacties tussen lanthanide houdende polyoxometalaten en proteïnen. KU Leuven
Selectieve hydrolyse van amidebindingen in proteïnen is één van de belangrijkste procedures in analytische biochemie, biotechnologie en moderne proteomica. De kinetische inertheid van de peptide binding, met een geschatte halfwaardetijd tussen 250 en 600 jaar bij fysiologische condities, zorgt er echter voor dat dit nog steeds een uitdagende manipulatie is. Onze preliminaire studies hebben aangetoond dat naast selectieve hydrolyse van hen egg ...
Het Pizza proteïne als startpunt voor nano-buizen en helicale fibrillen KU Leuven
Hoewel proteïnen beschouwd worden als diverse en belangrijke bouwstenen in de natuur is het toch DNA dat het meest succesvolle is binnen de biochemie en - nanotechnologie. De voorkeur voor DNA komt voort uit het feit dat de interacties van DNA-basenparen beter begrepen worden dan de interacties van proteïnen wat het maken ervan vergemakkelijkt. Verder is de synthese van DNA ook goedkoper. Toch hebben proteïnebouwstenen de afgelopen jaren meer ...
De rol van de Proteïne Fosfatase 2A Activator PTPA in KRAS-mutante niet-kleincellige longkankerontwikkeling en behandelingsresistentie KU Leuven
Omkeerbare eiwitfosforylatie, gekatalyseerd door kinasen en fosfatasen, is misschien wel een van de meest prominente signaaltransductiemechanismen in de menselijke cel. Eiwitfosfatase 2A (PP2A) is een belangrijke familie van serine / threonine-eiwitfosfatasen waarvan de leden betrokken zijn bij een breed scala aan cellulaire processen, zoals mitogene signalering, groei, celdeling, DNA-transcriptie, eiwittranslatie, signalering van DNA-schade ...