Projecten

Niet-coderende kleine (small) (s)RNA moleculen, ook wel kleine regulatorische sRNAs genoemd, worden niet vertaald in eiwitten maar functioneren op verschillende niveaus om genexpressie te reguleren. Een klasse van deze sRNAs zijn de microRNAs (miRNAs), die instaan voor de regulatie van de endogene genexpressie. De werkingsmechanismen van deze sRNAs zijn goed beschreven op het intracellulaire niveau, maar extracellulaire sRNAs zijn ...

Communicatie tussen cellen staat centraal in de normale werking van meercellige organismen. Beide tijdens ontwikkeling en homeostase is het duidelijk dat cellen enige signalen van andere cellen nodig hebben
hun omgeving voor hun normale functioneren. Cellulaire differentiatie is een van de processen die worden sterk beïnvloed door extracellulaire factoren: de micro-omgeving van een cel kan uniek zijn instructies die een cel naar een ...

In melanoomtumoren kunnen endotheelcellen, die bloedvaten omlijnen, veranderingen veroorzaken in melanoomcellen en andersom via intercellulaire communicatie. Deze veranderingen treden op in de genexpressie of het transcriptoom van de cellen, waardoor de functie van de cellen verandert en tumorgroei en uitzaaiing worden vergemakkelijkt. De mechanismen van deze intercellulaire communicatie en het effect op het transcriptoom van de cellen is nog ...

Binnen dit project zullen nieuwe computationele technieken ontwikkeld worden die het modelleren van intercellulaire communicatie verder gaan uitbreiden en verbeteren. In het bijzonder zullen we NicheNet, een recente state-of-the-art tool ontwikkeld in het Saeys lab, uitbreiden om echte systeembiologie mogelijk te maken en intercellulaire interacties te gaan modelleren in tijd en ruimte op basis van spatial transcriptomics data.

Voortbouwend op een reeks veelbelovende voorlopige resultaten, zal ik de hypothese testen dat autofagie-gedreven intercellulaire communicatie in het gestresste en abnormale tumorendotheel de melanoomgroei bevordert door het remmen van spontane en door therapie geïnduceerde immuniteit tegen kanker.

Het doel van het onderzoek is na te gaan hoe intercellulaire calcium communicatie via connexine kanalen kan bijdragen tot de vrijstelling van damage-associated molecular patterns (DAMPs)en de verspreiding van celdoodsignalen tussen tumor hersenendotheelcellen (ECn). De werkhypothese is dat een communicatie van DAMPs en celdoodsigalen tussen ECn de hersentumor op een meer efficiënte manier kan doen involueren in respons op ...

De doelstellingen van het onderzoeksproject zijn:

:AIM1 – Diepgaande karakterisering van stromale en immuunsamenstelling in het melanoom TME.

.AIM2 - Gericht op het intercellulaire TME-interactienetwerk in de muismodellen.

Verschillende cellulaire toestanden (TS,“tumor states”) komen voor in tumoren, waarbij sommige kankercellen actief delen, anderen differentiëren, naburig weefsel invaderen, uitzaaiingen veroorzaken of verkeren in een toestand die resistent is tegen therapie. De identificatie van de intrinsieke en extrinsieke mechanismen die TS diversiteit moduleren is essentieel voor de ontwikkeling van nieuwe therapeutische strategieën. In dit project ...

Verschillende cellulaire toestanden (TS,“tumor states”) komen voor in tumoren, waarbij sommige kankercellen
actief delen, anderen differentiëren, naburig weefsel invaderen, uitzaaiingen veroorzaken of verkeren in een
toestand die resistent is tegen therapie. De identificatie van de intrinsieke en extrinsieke mechanismen die TS
diversiteit moduleren is essentieel voor de ontwikkeling van nieuwe therapeutische strategieën. In dit ...