Projecten

Single-cell transcriptomics (scRNA-seq) kent momenteel een extreme groei in populariteit. Het laat onderzoekers toe om genexpressie te bestuderen op het niveau van individuele cellen, zodat complexe biologische processen als ontwikkeling en ziekte met ongekende resolutie bestudeerd kunnen worden. ScRNA-seq is in staat de expressie van duizenden genen in duizenden cellen gelijktijdig te meten, wat onderzoekers een globaal beeld verschaft van ...

Het veld van genexpressie-analyse met een enkele cel (scRNA-seq) kent een ongekende hausse
in populariteit. Het stelt onderzoekers in staat om genen in individuele cellen te bestuderen met een ongekende resolutie
en zal hun visie op complexe biologische processen, weefsels en ziekten revolutionair veranderen. De huidige
technologie, bijvoorbeeld, kan de expressie van duizenden genen in wel tien duizend profileren
cellen ...

Het doel is om een bewijs van concept te leveren en een basis voor verdere vergelijkbare studies in menselijke en muismodellen. We willen nieuw functioneel onderzoek initiëren om de rol van deze routes in de ontwikkeling van de ziekte aan te pakken. Verwacht wordt dat dit werk zal leiden tot inzichten in de cellulaire fase van de ziekte van Alzheimer, tot een meer omvattende aanpak om de stoornis te bestuderen en dat dergelijk werk nieuwe ...

We zullen de antivirale en immunomodulerende routes onderzoeken die de balans tussen asymptomatische infectie en ernstige ziekte verlengen. Deze complexe genoomwijde bevindingen zullen worden vertaald in gebruiksvriendelijke, klinisch bruikbare 'metrieken' die een persoonlijk gebruik van de momenteel beschikbare immunomodulerende geneesmiddelen mogelijk zouden maken.

Insecten behoren tot de meest succesvolle organismen op aarde. Een belangrijke verklaring voor dit succes is hun uitzonderlijke vermogen om op efficiënte wijze een grote variëteit aan voedingsstoffen te nuttigen. Net zoals andere heterotrofe organismen, moeten ook insecten hun essentiële nutriënten opnemen via het voedsel. Hun darmkanaal vormt hiervoor het centrale orgaan. De belangrijkste functies van dit orgaan zijn de efficiënte ...

In dit proefschrift wordt een nieuwe methode voorgesteld om state-of-the-art CMOS technologie – de basis van al onze hedendaagse elektronica – aan te wenden voor de elektrochemische fabricatie van DNA microarrays met een hoge dichtheid. DNA microarrays zijn een belangrijk hulpmiddel in genomisch onderzoek. Ze maken het mogelijk om duizenden genen tegelijkertijd te analyseren. Een gen is een stukje DNA dat de erfelijke eigenschappen van een ...

In dit project zullen we nieuwe methoden ontwikkelen om beter de spatiale context binnen weefsels functioneel te gaan karakteriseren. Hierbij beogen we de integratie van single-cell multi-omics (transcriptoom en proteoom), spatiale transcriptoomdata en confocale microscopie. Nieuwe machine learning technieken zullen ontwikkeld worden om de hoge spatiale resolutie van microscopie-technieken te combineren met de diepe phenotyperingscapaciteiten ...

Om de heterogeniteit van de TEC te karakteriseren, zal ik de meest recent ontwikkelde geavanceerde parallelle scG & T-sequencingtechnieken en bulk whole exome-sequencing gebruiken.

Toxine gemedieerde infectie van voedselpathogeen Bacillus cereus vereist een direct contact tussen levende B. cereus en zijn gastheer met een in-situ productie van enterotoxinen als gevolg. De cross-talk tussen B. cereus en intestinale cellen zal onderzocht worden aan de hand van functionele, cytotoxische en transcriptomische methoden, mbv. Seahorse flux analyzer, RNA-Seq, microarrays, RT-PCR, ELISA en massaspectrometrie.