Projecten
Benadering van gepersonaliseerde oncologie met DNA-methylatie-inferentie en computationele epigenomics KU Leuven
Epigenomische profielen hebben onbenutte capaciteit voor diagnostische en prognostische oncologische toepassingen. Ik veronderstel dat computationele methoden om de belangrijkste dimensies te begrijpen die tumor-epigenomen vormen - cellulaire heterogeniteit, genoom-epigenoom-interactie, kankercel van oorsprong en niet-genetische evolutie - cruciale gepersonaliseerde inzichten zullen opleveren in de micro-omgeving van tumoren, expressie van ...
Heeft HR een MC nodig? Universiteit Gent
Ziektes dragen bij aan grote verliezen in de landbouw en noodzaken een intensieve ziektebestrijding. Planten kunnen echter een eigen verdedigingsmechanisme lanceren die soms leidt tot de dood van cellen rondom de zone van infectie, genaamd hypersensitive response (HR). Wij waren de eerste om aan te tonen dat een een soort proteases, de metacaspasen (MCs), een belangrijke rol spelen tijdens HR. Door middel van proteomics en transriptomics ...
INFERENCE. Schaalbaar screening platform dat het werkingsmechanisme van genverstoringen voorspelt op basis van geïntegreerde transcriptionele en celfenotypische metingen. Universiteit Antwerpen
De rol van het scheut apicaal meristeem in het orchestreren van scheut groei in Zea mays Universiteit Gent
Mitochondriale aandoeningen: van diagnose over pathofysiologie naar therapie Universiteit Gent
Diagnostiek:
Het huidig diagnostisch platform wordt uitgebreid met implementering van transcriptomics en proteomics in samenwerking met het CMGG en het VIB. Er wordt ook ingezet op meer orgaan specifieke testing via opzetten van neuronale iPSC's waarbij mitochondriale functie via klassieke biochemische technieken (spectrofotometrie, BN-PAGE, zuurstofconsumptie) zullen worden geëvalueerd.
Pathofysiologie:
De uitwerking ...
Moleculair onderzoek naar het groeibevorderend effect van een Caulobacter sp. op Arabidopsis thaliana Universiteit Gent
Een Caulobacter sp., afkomstig van mais wortels, oefent een plantgroei bevorderend effect uit, zowel op mais als Arabidopsis thaliana. Tot op heden is er bijzonder weinig geweten over de moleculaire basis van deze plant-microbe interactie. Via transcriptomics, proteomics en phosphoproteomics wensen we moleculaire inzichten te verwerven in de processen die uiteindelijk aanleiding geven tot het specifieke groeibevorderend fenotype dat ...