Projecten
Transcriptoom gebaseerde bepaling van immunomodulaire therapeutische strategiën in bestaande en nieuwe virale epidemieën. KU Leuven
Human T-Cell Leukemia Virus Type 1 (HTLV-1) is een pathogeen retrovirus waar wereldwijd ongeveer 10 miljoen mensen mee geïnfecteerd zijn. Infectie met het virus kan twee verschillende ziekten veroorzaken: Adult T-cell leukemia/lymphoma (ATL) en HTLV-1 Associated Myelopathy of Tropical Spastic Paraparesis (HAM/TSP). De behandeling van ATL bestaat uit combinatietherapie met interferon (IFN) α en zidovudine. IFN-α is de internationaal aanvaarde ...
Pathologische bloedvat remodellering in hepatocellulair carcinoom: een ruimtelijk gepreciseerde single cel transcriptoom- en interactoomanalyse om nieuwe targets te identificeren KU Leuven
Hepatocellulair carcinoom (HCC) wordt gekarakteriseerd door drastische veranderingen in de levervasculatuur. De normale bloedtoevoer via de portale vene wordt nagenoeg overgenomen door de leverslagaders, terwijl de activatie van sinusoide celtypes leidt tot verlies van de sinusoidale fenestratie en tot microvasculaire capillarisatie. Dit verhoogt de weefselhypoxie en stimuleert verder HCC ontwikkeling. Het gastlabo toonde eerder aan dat HCC ...
Transcriptie op niveau van de cel in de vroege stadia van de ziekte van Alzheimer KU Leuven
De vroege stadia van de ziekte van Alzheimer zijn nog steeds slecht begrepen. Het is onbekend hoe de verschillende celtypes reageren op vroege amyloïde stress en hoe deze veranderingen door de verschillende hersenregio's verspreiden. Het doel van het project is het begrijpen van de vroegste stappen in de progressie van de ziekte van Alzheimer, binnen verschillende celpopulaties. Single-cell transcriptomics worden toegepast op een ...
HiSeq 2500: Hoge throughput volgende-generatie sequencer voor ultrasnelle en goedkope decodering van hele exomen , genomen, transciptomes , epigenomen en viromes Universiteit Gent
Hercules 1 - De Baere HiSeq 2500: high throughput volgende generatie sequencer voor ultrafest en goedkope decodering van hele exoom, genomen, transcriptomes, epigenomen en viromes. Herculesstichting AUGE / 13/23
Transcriptoom gebaseerde aanpak van transplant-gerelateerde longfibrose in chronische longafstoting na long- of stamceltransplantatie. KU Leuven
Achtergrond Chronische long allograft dysfunctie (CLAD) en chronische (beenmerg) graft versus host (gastheer) ziekte (cGvHD) zijn levensbedreigende aandoeningen die vaak voorkomen na longtransplantatie en allogene hematopoietische stamceltransplantatie. mechanismen geassocieerd met transplantgerelateerde longfibrose die leidt tot structurele veranderingen en longfalen in CLAD en long cGvHD zijn echter onvoldoende onbekend. Doelstellingen Het ...
Volledige lengte transcriptoom bepaling van KCNQ2-Encefalopathie tijdens de ontwikkeling met van iPSC afgeleide neuronen. Universiteit Antwerpen
Modelleren van intercellulaire signalisatieprocessen tijdens cellulaire differentiatie op basis van transcriptoom data van individuele cellen. Universiteit Gent
Communicatie tussen cellen staat centraal in de normale werking van meercellige organismen. Beide tijdens ontwikkeling en homeostase is het duidelijk dat cellen enige signalen van andere cellen nodig hebben
hun omgeving voor hun normale functioneren. Cellulaire differentiatie is een van de processen die worden sterk beïnvloed door extracellulaire factoren: de micro-omgeving van een cel kan uniek zijn instructies die een cel naar een ...
Deconvolutie van bulk tumor transcriptoom en DNA methylatie data ter identificatie van onderliggende celpopulaties. KU Leuven
In dit project zullen we daarom methoden ontwikkelen om tumorbulg-genexpressie en DNA-methyleringsdata te ontrafelen en de verschillende profielen van de normale en tumorcellen bloot te leggen.
De diversiteit van darmmacrofagen herbekeken: van transcriptoom naar functie KU Leuven
Macrofagen zijn van essentieel belang in het maagdarmkanaal. Ze bezitten uiteenlopende functies afhankelijk van hun positie in de verschillende lagen van de darm. Macrofagen in de darmmucosa worden voortdurend blootgesteld aan voedselantigenen en pathogenen, terwijl macrofagen in de muscularis externa verantwoordelijk zijn voor de darmmotiliteit. Recent onderzoek suggereert dat enterische neuronen een belangrijke rol spelen in het handhaven ...