Projecten
Ontwikkeling van een in situ padweg analyse systeem voor spatiale proteomie en gepersonaliseerde kankertherapie KU Leuven
Pathologische beoordeling bij kankerpatiënten is essentieel om de juiste diagnose te bepalen, wat een aanzienlijke invloed heeft op de prognose en het succes van hun therapeutisch plan. De recente introductie van ruimtelijke proteomics-technieken stelt pathologen in staat om een toenemend aantal vermeende biomarkers te evalueren op het niveau van de individuele cel. Deze ‘single-cell’ analyse heefPathologische beoordeling bij kankerpatiënten ...
Druppel gebaseerde microfluidica voor hoge-doorvoer, antilichaamvrije detectie van eiwitten op niveau van de individuele cel als respons op externe stimuli KU Leuven
Cellen in een populatie hebben een verschillend genoom, transcriptoom en proteoom, wat leidt tot unieke fenotypes en responsen op stimuli. Om die reden zijn er talloze single-cell analysetechnieken ontwikkeld die het toelaten om een onderscheid te maken tussen subpopulaties van cellen en om cellen met interessante kenmerken te identificeren. De domeinen van microfabricage en microfluïdica hebben een revolutie veroorzaakt in single-cell ...
Translationeel onderzoeksgericht technologieplatform voor analyse van individuele cellen KU Leuven
Single-cell analyse is een state-of-the-art methode geworden die wordt gebruikt bij translationeel onderzoek. Een grote uitdaging in het veld is echter het voorkomen van ongewenste cellulaire stress tijdens celisolatiestappen om transcriptionele processen niet te verstoren. Huidige projecten en toekomstig onderzoek van dit translationele consortium vereisen een dergelijke single-cell sorteerinfrastructuur voor de snelle isolatie van cellen ...
Het tumorendotheel: een over het hoofd gezien doelwit om immunotherapie te verbeteren? KU Leuven
Immunotherapy (IT) is een veelbelovende kankertherapie maar lijdt onder resistentie veroorzaakt door gebrekkige recrutering van immuuncellen naar het stroma van de tumor en door tolerantie. Om IT efficiënter te maken, stellen we voor om het immuunonderdrukkende gedrag van het tumorendotheel te onderzoeken en om tumorendotheelcellen (TEC) dusdanig te manipuleren dat ze immunocompetent worden en betere rekrutering van T cellen naar de tumor ...
Studie van het antifungaal werkingsmechanisme van plantdefensinen via analyse van individuele gistcellen KU Leuven
Jaarlijks veroorzaken invasieve schimmelinfecties (ISIs) zoals candidemia en invasieve aspergillose, 1,7 miljoen doden wereldwijd. Dit cijfer stijgt nog steeds, wat voornamelijk verklaard kan worden door een stijging in het aantal risicopatiënten, nl. patiënten met een verzwakt immuunsysteem, en het verhoogd gebruik van moderne medische apparaten, zoals implantaten en katheters. Bovendien is het sterftecijfer, geassocieerd met ISIs, hoog (tot ...
Functionele impact van veranderingen in DNA-methylatie. KU Leuven
Het doel van mijn onderzoek is om een meer solide basis en een beter begrip te geven van de rol van epigenetische veranderingen in ontwikkeling en in ziekten zoals kanker en veroudering. Hoewel er momenteel een explosie van onderzoeken is naar epigenetische veranderingen, is het vaak onduidelijk of de geïdentificeerde associaties alleen correleren met, dan wel oorzakelijk zijn voor het veranderde fenotype. Aangezien epigenetische ...
Ribosoomdefecten bij kanker. KU Leuven
Transformatie van een gezonde cel in een kankercel wordt veroorzaakt door accumulatie van defecten in vitale cellulaire eiwitten die de celcyclus, apoptose en respons op groeisignalen reguleren. Bij het bestuderen van T-cel leukemie ontdekten we dat kankercellen ook defecten kunnen krijgen in eiwitten van het ribosoom, het eiwitcomplex dat mRNA omzet in eiwitten. We vermoeden dat somatische ribosoomdefecten niet beperkt blijven tot T-cel ...
Eencellige omics-gegevensanalyse in translationele oncologie KU Leuven
Kanker bestaat uit (epi) genetisch en fenotypisch verschillende populaties van enkele cellen. Deze intra-tumor cellulaire heterogeniteit ligt ten grondslag aan therapeutische resistentie tegen kankerbehandeling. Het ontcijferen van intra-tumor cellulaire heterogeniteit, zowel in kankercellen als hun omliggende stromacellen tot aan de eencellige resolutie, is dus essentieel om therapeutische weerstand te bestrijden en om effectievere ...
Ontwikkeling van multimodale diepe neurale netwerken voor spatiale multi-omics data fusie KU Leuven
Biologische processen zijn complex van aard en bij het analyseren ervan in het licht van slechts één soort gegevensbron wordt belangrijke complementaire informatie niet in rekening gebracht. Single-cell multi-omics, en meer recentelijk spatiale multi-omica technologieën bieden een veelzijdig beeld van cel identiteit, weefsel microarchitectuur, cellulaire communicatie en pathofysiologie. Het doel van dit project is om nieuwe methoden te ...