Projecten
Whole genome sequencing en RNA sequencing voor aandoeningen van de bloedplaatjes KU Leuven
Dit project heeft als oogmerk om een snel, stamcel-gebaseerd, model te leveren om gekende en nieuwe genen te onderzoeken met CRISPR/Cas technologie, kwantitatieve in vivo imaging en genetische studie. Nieuwe genen zullen worden verworven uit WGS data van niet-gediagnosticeerde patienten met gekende aandoeningen van de bloedplaatjes, gesupplementeerd met transcriptoom data van de bloedplaatjes. Dit geeft de mogelijkheid tot WGS data analyse ...
Onthulling van de rol van FOXG1 in neurologische ontwikkeling en ziekte: een uitgebreide analyse met behulp van neurale organoĆÆden, beeldvorming en Single Cell Sequencing Universiteit Gent
Deze studie onderzoekt de rol van FOXG1 in neurologische ontwikkeling en ziekte. Het forkhead box G1 eiwit, gecodeerd door FOXG1, werkt als een transcriptionele repressor die voornamelijk tot expressie komt in de hersenen. Het is essentieel voor de ontwikkeling van de voorhersenen en daarvan afgeleide structuren. Bovendien zijn nauwkeurig afgestelde FOXG1-niveaus essentieel voor het balanceren van excitatoire en inhibitoire ...
Verbeterde karakteristering van het genetische risico van de ziekte van Alzheimer door middel van fine-mapping en long-read sequencing van DNA en single-nuclei RNA. Universiteit Antwerpen
Versnellen en automatiseren van de "next generation sequencing" workflow Universiteit Hasselt
LASTIG-FTD: applicatie op grote schaal van sequencing technologieƫn voor de identificatie van genomische factoren in frontotemporale dementie Universiteit Antwerpen
16S rRNA amplicon sequencing van vaginal swabs en biopten van endometrium Universiteit Antwerpen
Optische Genoom Mapping en long-read sequencing in lymfomen KU Leuven
Non-Hodgkin Lymfoom is een veel voorkomende hematologische maligniteit. Het is een heterogene ziekte die geclassificeerd kan worden in meer dan 60 verschillende entiteiten op basis van morfologie, immunofenotype en klinische karakteristieken. Genetische data wordt meer en meer geĆÆntegreerd bij de classificatie van NHL, wat de diagnose bevordert en belangrijke voorspellende biomarkers voorziet. Dit laat aangepaste therapieĆ«n toe. Deze ...
Next-generation sequencing diagnostiek om etiologieƫn van acute ongedifferentieerde koorts in het Peruaanse amazonegebied te identficeren Instituut voor Tropische Geneeskunde
In de tropen blijft ~50% van de patiƫnten met acute ongedifferentieerde koortsaandoeningen (AUFI) ongediagnosticeerd. De differentiƫle diagnose, die belangrijk is om de behandeling en het casemanagement te sturen, wordt bemoeilijkt door verschillende factoren, waaronder een grote verscheidenheid aan (on)bekende ziekteverwekkers die AUFI veroorzaken, een groot aantal overlappende symptomen waardoor klinische diagnoses onbetrouwbaar zijn, ...