Projecten
Identificatie en studie van NOTCH1 gereguleerde long noncoding RNAs betrokken in het onstaan van T-cel acute lymfoblastaire leukemie Universiteit Gent
T-cel acute lymfoblastische leukemie (T-ALL) resulteert uit de ongecontroleerde proliferatie van rijpe T-cel precursors. Verschillende mogelijke genetische defecten in oncogenen en tumorsuppressorgenen geïdentificeerd samenwerken in T-ALL ontwikkeling. Oncogene NOTCH1 activerende mutaties van bijzonder belang als ze worden gevonden in meer dan 50% van de T-ALL gevallen markering NOTCH1 als een belangrijk therapeutisch doel. Onlangs is een ...
Transport- en opnamemechanismen van extracellulaire RNA's bij insecten. KU Leuven
De opkomst van high-throughput sequencing-methoden heeft onze kijk op hoe genomen georganiseerd zijn, en op hoe ze het fenotype van een organisme kunnen beïnvloeden, drastisch veranderd. Grote delen van metazoïsche genomen coderen niet voor proteïnen. Echter, dit betekent niet noodzakelijk dat deze regio's slechts 'junk-DNA' zijn, aangezien ze nog steeds aanleiding kunnen geven tot een diversiteit aan transcriptcategorieën met specifieke ...
De rol van lange niet-coderende RNA's in T-cel acute lymfoblastische leukemie Universiteit Gent
Dit project bestaat uit vier doelstellingen: (1) het bestaande microRNA-boodschapperRNA netwerk in T-ALL uitbreiden en het opsporen van lange niet-coderende RNAU+2019s met een rol in T-ALL, (2) de directe transcriptionele controle van NOTCH1 op de expressie van lange niet-coderende RNAU+2019s onderzoeken, (3) NOTCH1/lncRNA/miRNA netwerken identificeren en (4) functionele in vitro en in vivo studies uitvoeren op geselecteerde lange ...
Single cel RNA en kleine niet-coderende RNA sequencing om biomerkers te identificeren voor de pathogenese en behandelingsrespons van type 1 diabetes KU Leuven
Om klinische vertaling mogelijk te maken, zijn er diepgaande inzichten in de werkingswijze en de identificatie van robuuste (perifere) biomarkers die niet alleen de ziekteverschijnselen blootleggen, maar ook de respons op therapieën meten en de prognose van patiënten voorspellen. We stellen voor om perifeer bloed en van eilandjes afgeleide T-cellen te analyseren tijdens ziekteprogressie bij diabetes-gevoelige NOD-muizen en van ...
Single cel RNA en kleine niet-coderende RNA sequencing om biomerkers te identificeren voor de pathogenese en behandelingsrespons van type 1 diabetes KU Leuven
Type 1 diabetes (T1D) is een auto-immuunziekte die het gevolg is van door T-cellen gemedieerde afbraak van de beta-cellen van de alvleesklier, waardoor de bloedglucose ontregeld wordt. We hebben een unieke methode bedacht voor het herstel van tolerantie bij auto-immune diabetische muizen met behulp van darmafgifte van bacteriën die genetisch zijn gewijzigd om proinsuline samen met de immuunregulerende cytokine IL10 af te scheiden. Om ...
Lange niet-coderende RNAs in kanker: ontrafelen van de donkere materie van het kankergenoom Universiteit Gent
Het humane genoom wordt op brede schaal afgeschreven en produceert duizenden niet-gekarakteriseerde lange niet-coderende RNAs (lncRNAs). Met dit project beogen we nieuwe lncRNAs met therapeutische of biomerker toepassing te identificeren. Dit gebeurt op basis van een uitgebreide exploratie en validatie procedure, ondersteund door nieuwe laboratorium technologieën en data-analyse strategieën die in de loop van het project ontwikkeld zullen ...
Lange niet-coderende RNAs betrokken in de regulatie van tumor immunogeniciteit Universiteit Gent
Elke cel in ons lichaam bevat een kopie van ons genetisch materiaal of DNA. DNA bevat de blauwdruk voor de productie van eiwitten, kleine machines die belangrijke processen in de cel uitvoeren, zoals het reguleren van de suikerinname, het transporteren van zuurstof enz. Om deze eiwitmachines te maken wordt de informatie van de DNA blauwdruk naar de fabriek van de cel gebracht via een intermediaire molecule genaamd boodschapper RNA. Tien jaar ...
Kankerspecifieke circulerende RNAs als biomerkers voor diagnose en opvolging van therapierespons Universiteit Gent
In de zoektocht naar nieuwe biomerkers voor kanker is het gebruik van vloeibare biopsieën zoals plasma heel aantrekkelijk. Plasma kan namelijk verkregen worden via een gewone bloedafname, in tegenstelling tot weefselbiopten die meer invasieve en pijnlijke procedures vereisen. De gemakkelijke collectie laat ook toe om herhaaldelijk stalen af te nemen gedurende de behandeling en opvolging van kankerpatiënten. Zo zouden kankerbiomerkers in ...
Ontdekking en functionele analyse van kleine RNA's en RNA-bindende eiwitten afkomstig van faag KU Leuven
In de afgelopen jaren is het bewijs dat kleine RNA's (sRNA) een belangrijke regulerende rol spelen in zowel eukaryoten als in bacteriën. In modelpathogenen zoals Escherichia coli en Salmonella kunnen deze regulerende moleculen elk stadium van transcriptie en translatie beïnvloeden door basenparing met hun doelwit. Bij de opportunistische pathogeen Pseudomonas aeruginosa is aangetoond dat kleine RNA's betrokken zijn bij ijzerverwerving, ...