Projecten
Nieuwe cross-link technologieën voor het aantonen van peptideligand/receptor interacties Universiteit Gent
In het huidig project zal getracht worden aan de hand van peptiden met een onnatuurlijke furylalanine aminozuurbouwsteen, een nieuwe methode te ontwikkelen voor labeling van peptiden en proteïnen en proteïne-proteïne crosslinking. Door selectieve oxidatie van de furaneenheid in waterig midden zal deze omgezet worden tot een reactieve enalfunctionaliteit, die dan vervolgens kan reageren met nabije nucleofiele functies op de proteïnen.
Transfereerbare deep learning om moleculaire interacties te voorspellen aan de hand van sequenties. Universiteit Antwerpen
Microbiële interacties in waterstofoxiderende gemeenschappen Universiteit Gent
Inzicht in de reactiviteit en moleculaire interacties tussen lanthanide houdende polyoxometalaten en proteïnen. KU Leuven
Selectieve hydrolyse van amidebindingen in proteïnen is één van de belangrijkste procedures in analytische biochemie, biotechnologie en moderne proteomica. De kinetische inertheid van de peptide binding, met een geschatte halfwaardetijd tussen 250 en 600 jaar bij fysiologische condities, zorgt er echter voor dat dit nog steeds een uitdagende manipulatie is. Onze preliminaire studies hebben aangetoond dat naast selectieve hydrolyse van hen egg ...
Detectie van DNA-peptide interacties via cross-linking: bidirectionele toepassing van de furan-oxidatie methodologie Universiteit Gent
Door middel van synthese van major groef-bindende peptiden met een onnatuurlijke furan-aminozuurbouwsteen zal getracht worden een in Kyoto ontwikkeld modelsysteem dat op eenvoudige wijze synthetisch kan gemodificeerd worden met de gewenste crosslink functionaliteit. Na complexvorming met DNA-duplexen zal door selectieve oxidatie, de furaneenheid in waterig midden omgezet worden tot een reactieve enalfunctionaliteit, die dan vervolgens kan ...
Detectie van DNA-peptide interacties via crosslinking: bidirectionele toepassing van de furan-oxidatie methodologie. Universiteit Gent
Door middel van synthese van major groef-bindende peptiden met een onnatuurlijke furan-aminozuurbouwsteen zal getracht worden DNA-peptide crosslinking te bewerkstelligen. Na complexvorming met DNA-duplexen zal door selectieve oxidatie, de furaneenheid in waterig midden omgezet worden tot een reactieve enalfunctionaliteit, die dan vervolgens kan reageren met de nucleofiele exocyclische aminefuncties van de DNA basen in major groef.
Screening voor inhibitoren van eiwitfosfatasen die mitotische celdood in kankercellen induceren KU Leuven
Kanker is een frequent voorkomende ziekte en vormt één van de belangrijkste doodsoorzaken in de moderne wereld. De taxanen en vinca alkaloïden spelen een belangrijke rol in de behandeling van veel soorten kankers. Deze stoffen doden kankercellen in mitose door het spindle assembly checkpoint (SAC) chronisch geactiveerd te houden en mitotische celdood te induceren. Het therapeutisch gebruik van deze stoffen kent echter twee belangrijke ...
Drie bioassays voor een tweevoudig doel: Dopingcontrole & Kankeronderzoek Universiteit Gent
Dit project beoogt de ontwikkeling van nieuwe strategieën die toelaten om de dynamiek te bestuderen van proteïne-proteïne interacties (PPIs) binnen de hypoxie-induceerbare factor (HIF)- signalering in de cel. Drie PPIs zullen bestudeerd worden in de context van doping en kankeronderzoek: HIF1a-HIF1b heterodimerisatie, de interactie tussen HIF1a en Von Hippel
Lindau tumor suppressor proteïne en de interactie tussen HIF1a en coactivator ...
Inzicht in biotische stress in plantenwortels via moleculaire interactoomanalyse in tomaat Universiteit Gent
Tomatenwortels worden voortdurend blootgesteld aan organismen uit hun rhizosfeer, zoals nematoden, schimmels en bacteria. Proteïne-proteïne interacties zijn essentieel voor het bepalen van de relaties tussen deze organismen. Daarom zullen we een platform ontwikkelen om het proteïne-interactienetwerk van de respons van tomatenwortels op deze biotische signalen te visualiseren en in kaart te brengen en de sleutelelementen hierin te ...