Projecten
Big data platform voor hosting en analyse van mass spectrometry imaging data KU Leuven
Het doel van dit project is de uitbouw van een Big Data cloud platform om data uit mass spectrometry imaging (MSI) op te slaan, te delen en gedistribueerd te analyseren.
Manifold learning voor de visualisatie, prioritisatie en data fusion van Mass Spectrometry Imaging data KU Leuven
Mass Spectrometry Imaging (MSI) is een krachtige moleculaire beeldvormingstechnologie die de spatiale verdeling van moleculen in een weefselcoupe kan detecteren. Omdat MSI geen a priori labeling vereist, is de techniek zeer populair geworden voor de exploratieve vergelijking van metabolieten, lipiden, peptiden en proteïnen tussen de verschillende weefselregio's. Vermits het aangetoond is dat tumorale heterogeniteit een belangrijke rol speelt ...
Machine learning voor Massa Spectrometrie Imaging KU Leuven
Een massa spectrometrie imaging experiment resulteert in zeer grote, hoog dimensionale data sets die moeilijk te analyseren zijn. Deze soort data bevat enorme hoeveelheden aan diverse informatie over ziektes, behandelingen enzovoort. Met behulp van machine learning technieken willen we nieuwe inzichten vinden in deze data. Ook willen we meer efficiënte technieken vinden om deze soort data te analyseren.
Moleculaire massa spectrometrie gebaseerde imaging Universiteit Antwerpen
Het in kaart brengen van amyloide-geinduceerde neurodegeneratie in de darm met MALDI imaging. Universiteit Antwerpen
Het stimuleren van biomedische beeldgegevensanalyse door middel van geavanceerd machinaal leren KU Leuven
Mass spectrometry imaging (MSI) is a promising, label-free molecular imaging technology, which enables mapping the spatial distribution of hundreds to thousands of biomolecules in a tissue within a single experiment. Additionally, as it is a label-free and untargeted molecular imaging technology, it does not require prior knowledge about the tissue or target-specific reagents. Due to those outstanding characteristics, MSI is becoming ...
Temporeel en ruimtelijk geresolveerde multi-element informatie op de micro- en nanoschaal: ontwikkeling van nieuwe analytische methodes en hun toepassing in ‘metallomics’ en nanotechnologie Universiteit Gent
Tot op heden zijn de meeste ICP-massaspectrometers uitgerust met een massaspectrometer van het "scanning-type" (quadrupoolfilter, sector-veld MS). Voor korte transiënte signalen kan dit echter de mogelijkheden van elementanalyse beperken tot een mono-nuclide aanpak. Onlangs is een nieuw type ICP-time-of-flight-MS (ICP-TOFMS) ontwikkeld, waarmee een quasi-simultane monitoring van het volledige massaspectrum (21 000 massaspectra /s) en een ...
Toegepaste wiskunde voor proteomica KU Leuven
Mass Spectrometry Imaging (MSI) is een exploratieve scantechniek die de chemische samenstelling van biologische weefsels analyseert. Via straling met een laser op meerdere (x,y)-coördinaten worden molecules geïoniseerd en kan hun massa-over-ladingratio (m/z-ratio) gemeten worden. Dit resulteert in erg grote datasets met dimensies x, y en m/z. Tegenwoordig kan de data reeds tientallen gigabytes aan geheugen innemen en met steeds verbeterde ...
Computationele Massaspectrometrische Beeldvorming van Amyloïde Plaque Populaties in de Hersenen van Niet-Demente en Ziekte van Alzheimer Patiënten KU Leuven
De activiteit van de ziekte van Alzheimer (AD) is betrokken bij meerdere fysiologische processen en speelt een sleutelrol bij de pathogenese van deze ziekte. AD-veroorzakende mutaties in Preseniline (PSEN1/2) (de katalytische kern van γ-secretase) en het Amyloïdprecursoreiwit (APP) verminderen consistent het aantal γ-secretase splijten op het APP C99-substraat, wat leidt tot de productie van langere amyloïde Aβ-peptiden. Het pathogene mutante ...