Projecten
Ontwikkeling van biomechanische algoritmen voor de beoordeling van fietsers met behulp van de 4D full body dynamische scanner. Universiteit Antwerpen
Computationele raamwerken voor complexe ziektestratificatie met behulp van grootschalige datasets KU Leuven
"FunTCR": Karakterisering van specifieke humane TCR's via TCR-seq, door in silico en in vitro analyse van T-cellen gestimuleerd met tumorgeassocieerde en virale antigenen, om nieuwe TCR-T-cellen te ontwikkelen. Universiteit Antwerpen
Ontwikkeling en toepassing van dim donoren voor FADED en andere FRET sensoren KU Leuven
Fluorescerende eiwitten zijn een essentieel onderdeel voor elk biochemisch of life-science onderzoek. Een veelgebruikte toepassing voor deze eiwitten zijn FRET-experimenten. Deze experimenten zijn vaak ontwikkeld rond een variërende afstand tussen de fluoroforen, donor en acceptor. Om deze afhankelijkheid van onderlinge afstand te omzeilen, zullen we ons richten op de ontwikkeling van FADED, waarbij een verandering in de relatieve oriëntatie ...
Collaboratieve licentiemodellen voor genetische bronnen uit de zee in het streven naar een efficiënt, toegankelijk en rechtvaardig beheer van intellectuele eigendomsrechten KU Leuven
Analyse van hoge-doorvoer genoom bewerking KU Leuven
De thesis zal zich initieel focussen op het genetisch manipuleren van E.Coli cellen dmv CRISPR-CAS technieken om synonymous mutaties in te brengen. Deze mutaties zullen dan bestudeerd worden om hun effect op het phenotype te bepalen. Hierna zal de focus gelegd worden op het ontwikkelen van applicaties die kunnen helpen bij het voorstellen van de effecten van nieuwe synonymous mutaties gaan hebben op het phenotype.
Geavanceerde impedimetrische systeemkarakterisatie voor ingenieurs- en levenswetenschappen Universiteit Gent
In de voorbije jaren zijn er enkele doorbraken geweest in het gebruik van elektrochemische impedantiespectroscopie voor de karakterisatie van (bio)elektrochemische systemen. Het volle potentieel van deze methode is echter nog niet volledig ontdekt. In dit interdisciplinair onderzoeksproject zal ik samen met experten vorderingen maken in de impedimetrische analyse van elektrische stroombronnen, bacteriële biofilms en planten d.m.v. nieuwe ...
Genregulatie begrijpen in een heel dier: Van het bouwen van een regulatie-atlas tot het decoderen van genregulatie met deep learning KU Leuven
Meercellige organismen bestaan uit cellen met verschillende morfologieën en functies, maar toch delen alle cellen dezelfde genetische code. Genregulerende netwerken (GRN’s) regelen de plaats- en tijdafhankelijke expressie van genen en via genregulatie worden verschillende celtypes gegenereerd en in stand gehouden. GRN’s ontstaan door interactie van transcriptiefactoren (TFs) en enhancers. Enhancers zijn cis-regulerende gebieden in het genoom ...
Gencorrectie voor mucoviscidose - de vertaalbaarheidsdrempel aanpakken KU Leuven
Dit project richt zich op nieuwe methoden voor gencorrectie en toeleveringsmethoden om een gentherapiebehandeling te ontwikkelen voor de monogenetische ziekte taaislijmziekte of muoviscidose, die zich voornamelijk manifesteert als longziekte. Doelstellingen: (1) Het gebruik van gencorrectie (met name base & prime editing) voor efficiënte correctie van CFTR (mutaties in het CFTR-gen zijn verantwoordelijk voor taaislijmziekte) in primaire ...