Projecten
Understanding Gene ENvironment Interaction in ALcohol-related hepatocellular carcinoma (GENIAL). Vlaams Instituut voor Biotechnologie
Een genoom-brede benadering om adaptatie aan omgevingsstressoren te kwantificeren in de watervlo Daphnia magna. KU Leuven
Genexpressie is een centraal proces in de biologie van een cel, dat het fenotype beïnvloedt op cel-, weefsel- en organismeniveau. Het ligt ten grondslag aan fundamentele biologische processen, gaande van ontwikkeling – met inbegrip van de ontwikkeling van ziekten – tot reacties op milieuomstandigheden. De complexiteit van deze processen wordt weerspiegeld in de complexiteit van de regulering van genexpressie. Genen en hun producten vormen ...
Gebruik van nieuwe generatie sequentietechnologie voor de identificatie van functionele transcriptionele doelgenen. KU Leuven
Terwijl kanker zonder enige twijfel een genetische aandoening is, zijn er steeds meer indicaties dat de ziekte ook veel eigenschappen deelt met processen uit de ontwikkelingsbiologie. Kanker cellen kunnen inderdaad beschouwd worden als een mogelijk cel type dat ontstaat door het vergaren van specifieke mutaties die de regulatorische staat van de cel wijzigt. Uiteindelijk zijn het zeer specifieke gen regulatorische netwerken (GRN) die aan de ...
In silico modellering van osteochondrale pathofysiologie en regeneratie. Identificatie van moleculaire kenmerken en therapeutische doelwitten met mechanistische en datagestuurde netwerkmodellen KU Leuven
“in silico modelleren van osteochondrale pathofysiologie en regeneratie:
Identificatie van moleculaire kenmerk en medicijndoelen met mechanistische en gegevensgestuurde netwerkmodellen”
Chondrocyt maturatie en kraakbeen naar bot transitie in de context van de groeischijf ontwikkeling en osteoarthritis (OA) is een proces dat grondig gereguleerd wordt met input van meerdere biochemische en mechanische signalen actief op ...
Van modelsysteem tot gewas: een network-gebaseerde benadering voor het accuraat vertalen van biologische kennis in planten Universiteit Gent
Onze kennis omtrent de moleculaire mechanismen die verantwoordelijk zijn plantengroei is het laatste decennium sterk toegenomen, voornamelijk door onderzoek in het modelsysteem Arabidopsis thaliana. Het vertalen van deze functionele eigenschappen naar gewassen met meer complexe genomen is niet evident en dit project stelt een nieuwe systeem-biologische benadering voor om dit op een accurate manier uit te voeren.
Inzicht in Vroege Menselijke Ontwikkeling met Behulp van Nieuwe Eencellige Technologieën en Stamcelgebaseerde Embryomodellen KU Leuven
Karakterisering van cis-regulatorische codes en netwerken in Drosophila door een combinatie van genetische perturbaties, digitale genexpressie en bioinformatica. KU Leuven
Neuraal-netwerk-gebaseerde gegevensintegratie voor het screenen en clusteren van patiënten via vloeistofbiopsies met toepassing op presymptomatische kankerdetectie en gestratificeerde geneeskunde KU Leuven
Mijn doctoraatsonderzoek richt zich op het ontwerp van een artificiële-intelligentieraamwerk (AI) voor het leren van complexe relaties tussen het DNA-profiel van een vloeistofbiopsie (d.w.z. DNA gezuiverd uit een bloedmonster) en de diagnose, prognose of terugval van een tumor. Dit AI-raamwerk zal in staat zijn om continu informatie uit DNA-profielen van tienduizenden vloeistofbiopsies te integreren. Het zal met name modellen voor de vroege ...
Toepassingen van probabilistische logica KU Leuven
Toepassingen (e.g. binnen het domein van de bio-informatica) van probabilistische logica worden onderzocht