Projecten
Decoding and controlling cell-state switching: A bottom-up approach based on enhancer logic Vlaams Instituut voor Biotechnologie
Ontcijferen van de enhancer logica, onderliggend aan cellulaire identiteit tijdens human neurale buis en neurale lijst ontwikkeling, gebruikmakend van single-cell multi-omics en machine learning. KU Leuven
Precieze, robuuste and evolutionair geconserveerde mechanismen liggen aan de basis van de ontogenese van cellulaire identiteiten. Enhancers spelen een belangrijke rol, door de temporele en spatiële expressie van factoren betrokken in de identiteit van cellen te regelen. Eigenschappen van enhancers zijn reeds uitvoerig gedocumenteerd, doch zijn de fundamenteel moleculaire mechanismen onderliggend aan de werking van enhancers in grote maten ...
Enhancer logica en transcriptionele regulatie exploiteren om fenotype switching in melanomen te sturen KU Leuven
Enhancers zijn regulatorische genomische regio’s die een belangrijke rol spelen in genregulatorische netwerken. Tezamen met sekwentie-specifieke transcriptiefactoren die binden op de enhancers, regelen ze de expressie van hun doelwit genen, en, uiteindelijk, het fenotype van een cel. Melanomen zijn een van de meest gevaarlijk en moeilijk te behandelen kankertypes. Zowel de cellulaire heterogeniteit als plasticiteit van melanoom cel statussen ...
Silicium Alloying Anodes voor High Energy Density Batterijen bestaande uit Lithium Rich Cathodes en Safe Ionic Liquid Elektrolyten voor Enhanced High VoltagE Performance. KU Leuven
Si-DRIVE will develop the next generation of rechargeable Li-ion batteries, allowing for cost competitive mass market EVs by transformative materials and cell chemistry innovations, delivering enhanced safety with superior energy density, cycle life and fast charging capability using sustainable and recyclable components.The technology encompasses amorphous Si coated onto a conductive copper silicide network as the anode with polymer/ionic ...
Decoderen en besturen van cell-state switching: een bottom-up benadering op basis van enhancer-logica KU Leuven
Cell-state switching in cancer allows cells to transition from a proliferative to an invasive and drug-resistant phenotype. This plasticity plays an important role in cancer progression and tumour heterogeneity. We have made a striking observation that cancer cells of different origin can switch to a common survival state. During this epigenomic reprogramming, cancer cells re-activate genomic enhancers from specific regulatory programs, such ...
Genregulatie begrijpen in een heel dier: Van het bouwen van een regulatie-atlas tot het decoderen van genregulatie met deep learning KU Leuven
Meercellige organismen bestaan uit cellen met verschillende morfologieën en functies, maar toch delen alle cellen dezelfde genetische code. Genregulerende netwerken (GRN’s) regelen de plaats- en tijdafhankelijke expressie van genen en via genregulatie worden verschillende celtypes gegenereerd en in stand gehouden. GRN’s ontstaan door interactie van transcriptiefactoren (TFs) en enhancers. Enhancers zijn cis-regulerende gebieden in het genoom ...
Evolutie van de genomische regulatorische code die ten grondslag ligt aan neuronale diversiteit KU Leuven
De hersenen vertonen de grootste diversiteit aan celtypes van al onze organen. De verscheidenheid aan neuronale celtypes ontstaat tijdens ontwikkeling, als gevolg van een precieze spatiotemporele controle van de genexpressie. Momenteel zijn de exacte combinaties van transcriptiefactoren, de genomische enhancers waaraan zij zich binden, en de doelgenen die zij reguleren, weinig gekarakteriseerd. Om te onderzoeken hoe deze complexe en ...
Ontrafeling van genregulerende netwerken met enkele cel in Drosophila KU Leuven
Genexpressie-dynamica levert verschillende celtypen, weefsels en verschillende fenotypen op, en wordt ruimtelijk tijdsgeoriënteerd door cis-regulerende elementen. Versterkers fungeren bijvoorbeeld als genactiveringsschakelaars die functioneren bij binding van transcriptiefactoren (TF). Tijdens de ontwikkelingsstadia van Drosophila melanogaster bepalen variërende activatie- en combinatorische effecten van enhancers de transcriptionele ...
Deep learning oplossingen voor het ontcijferen van genregulatie in het menselijk brein KU Leuven
Het menselijk genoom bevat meer dan een miljoen enhancers en promotors die genexpressie regelen. De sequentie van deze regulatorische gebieden bepaalt welke transcriptiefactoren kunnen binden. Samen bepalen zij de identiteit van een cel. Ontcijferen hoe de DNA-sequentie van enhancers ten grondslag ligt aan celtype-specifieke activiteit is een belangrijke uitdaging in het verdere begrip van genregulatie. Bovendien is het grotendeels onbekend ...