Projecten
De studie van mutaties in het mitochondriaal genoom van humane pluripotente stamcellen door middel van massive parallel sequencing Vrije Universiteit Brussel
Bepalen van virale en bacteriële kolonisatie van de lage luchtwegen bij mucoviscidosepatiënten door metagenome sequencing en multiplex qPCR. Universiteit Antwerpen
Centrum voor whole genomen sequencing van Mycobacterium tuberculosis Universiteit Antwerpen
Directe integratieve sequencing van cellen van patiënten met acute lymfatische leukemie KU Leuven
Leukemie is een complexe ziekte die wordt veroorzaakt door de ophoping van oncogene laesies bij het ontwikkelen van lymfoïde cellen. Deze hematologische maligniteit vertoont uitgebreide genetische intra-tumorale heterogeniteit. We begrijpen echter nog steeds niet volledig hoe het zich ontwikkelt, het exacte type cellen waaruit het bestaat en de gevoeligheid van de verschillende cellen voor de behandeling. Om heterogeniteit te ontleden, is het ...
Detectie van zoönotische bacteriën in knaagdierstalen uit Afrika aan de hand van 16S metagenomic sequencing. Universiteit Antwerpen
Derde generatie sequencing voor de detectie van cryptische structurele genoom en methyloom variatie in patienten met ontwikkelingsstoornissen. KU Leuven
Twee decennia geleden werd de voltooiing aangekondigd van een kaart van het menselijk genoom. Die is essentieel gebleken bij het bepalen van de genetische basis van ziektes. Helaas kon 10% van het genoom niet worden geanalyseerd. Ongeveer 40% van de patiënten blijft tot op vandaag zonder moleculaire verklaring voor hun aandoening. Nu kunnen we, door middel van revolutionaire long read sequencing-technologie, voor het eerst deze verborgen ...
LASTIG-FTD: applicatie op grote schaal van sequencing technologieën voor de identificatie van genomische factoren in frontotemporale dementie Universiteit Antwerpen
Nauwkeurigere detectie van biomerkers predictief voor kanker immuuntherapie respons met een Nanopore Long-read- gebasseerde sequencing technologie KU Leuven
De laatste jaren heeft immunotherapie (met name de immuun checkpoint inhibitoren) een opmerkelijk klinisch succes geboekt voor de behandeling van verschillende kankertypes. Genetische schade, de expressie van retrovirale elementen die zich in ons DNA inegreerden en het aantal cytotoxische T cellen in de tumor zijn mechanismen die aan de basis om het immuunsysteem de kanker te laten herkennen en af te breken. Om deze echter aan te wenden als ...