Projecten
Implementatie van long-read metagenomische sequencing in precisiegeneeskunde en antibioticabeleid bij acute luchtweginfecties. Universiteit Antwerpen
Versnellen en automatiseren van de "next generation sequencing" workflow Universiteit Hasselt
Richting volledige dsDNA virus genomen: Derde-generatie sequencing en herpesvirussen diversiteit KU Leuven
Humaan cytomegalovirus (HCMV), het prototype van de herpesvirus-subfamilie Betaherpesvirinae is een alomtegenwoordig virus met seroprevalenties variërend van 45 tot 100% bij volwassenen [1]. Primaire infecties bij gezonde kinderen en volwassenen zijn meestal asymptomatisch, maar het virus veroorzaakt een levenslange persistentie en latente infectie, van waaruit het kan worden gereactiveerd en het nageslacht infecteren[2]. HCMV kan ernstige ...
LeapSEQ: Efficiënte data processing oplossingen voor adaptieve en mobiele genoom sequencing, toegepast op monitoring van infectieziekten. Universiteit Antwerpen
Deep Sequencing van myeline-reactieve T-cellen om nieuwe ziektemechanismen op te helderen en correlaten te identificeren voor de respons op de behandeling Universiteit Antwerpen
Met zorg omgaan met technologie: De introductie van next-generation sequencing in de diagnostische klinische praktijk KU Leuven
Toen het menselijk genoom aan het begin van de jaren 2000 voor het eerst in kaart werd gebracht, waren de verwachtingen over de invloed ervan op ons begrip van de menselijke gezondheid en klinische zorg hooggespannen. De opgedane kennis en het daarmee samenhangende enthousiasme voor toekomstige successen stimuleerden de ontwikkeling van snellere en meer kosteneffectieve DNA-sequencing technieken. Deze next, of tweede, generatie van sequencing ...
Kweekvrije benaderingen, met inbegrip van whole genome sequencing, ter ondersteuning van diagnostische en transmissie studies van Mycobacterium leprae Universiteit Antwerpen
Ontwikkeling van een nieuwe test om het HIV-1 reservoir te karakteriseren met behulp van long-read sequencing Universiteit Gent
Humaan Immunodeficiëntie Virus (HIV) is in staat om ons immuunsysteem te infecteren en kan leiden tot AIDS. De huidige behandelingen kunnen de voortgang van de HIV-infectie stoppen maar bieden geen volledige genezing aangezien steeds een kleine fractie inactief HIV buiten het bereik van de medicatie blijft, het zogenaamde ‘latente reservoir’. Indien een behandeling wordt onderbroken, kan hierdoor al binnen enkele weken een rebound van de ...
Opvolging van meervoudig myeloma door low-pass sequencing van cfDNA. KU Leuven
Meervoudig Myeloom (MM) is een kwaadaardige aandoening die vanwege haar genetische complexiteit in alle gevallen bijzonder moeilijk op te volgen is. Dit probleem wordt verder uitvergroot door technische beperkingen die de afscheiding van abnormale plasmacellen uit stalen bemoeilijken. Daarenboven wordt de evolutie van de aandoening, van een Monoclonal Gammopathy of Undetermined Significance (MGUS) tot leukemie van de plasmacellen, gekenmerkt ...