Projecten
Doorbreken van de darmbarrière tijdens cirrose: een cel-voor-cel analyse van hoe zieke macrofagen pathologische bacteriële translocatie naar de lever niet kunnen voorkomen KU Leuven
In dit project zullen we de belangrijkste klinische vraag behandelen waarom de darmbarrière gecompromitteerd raakt bij cirrose, door specifiek te focussen op de rol van intestinale macrofagen tijdens de afbraak van de barrière. We streven ernaar om de transcriptoomhandtekeningen van de functioneel verschillende niche-specifieke macrofagen op eencellig niveau in de darm in kaart te brengen met behulp van unieke muismodellen en klinisch ...
Definiëren van signaturen op single cel niveau in de darmen die intestinale barrière disfunctie tijdens cirrose bevorderen KU Leuven
Cirrose wordt geassocieerd met bacteriële translocatie die geleidelijk leidt tot immuundysfunctie. Patiënten zijn echter niet allemaal even gevoelig voor bacteriële infecties. Inzicht in de immuunrespons op spontane bacteriële infecties, ontstekingen en verwondingen is cruciaal voor de risico-evaluatie en de doelgerichte therapieën bij cirrosepatiënten. In het bijzonder voor patiënten met spontane bacteriële peritonitis (SBP), dewelke een ...
Calcium regelt de intrinsieke dynamiek van Type 3 Translocase-exportpoort om clientsecretie te schakelen KU Leuven
Het type drie secretiesysteem (T3SS) is een multiproteïne (20-30) transmembraancomplex dat door Gram-negatieve organismen wordt gebruikt om bacteriële cytoplasmatische eiwitten af te leveren aan het cytoplasma van de gastheercel. De aanmaak en uitscheiding via de T3SS wordt heel precies geregeld door de bacteriecel. De T3SS is een zeer belangrijk virulentiemechanisme voor veel pathogene organismen. Dit systeem is de afgelopen drie decennia ...
Het ontrafelen van de heterogene aard van gastheer/pathogeen interacties en hun rol in bacteriële pathogenese. Universiteit Gent
Bacteriële infecties behoren wereldwijd tot de belangrijkste doodsoorzaken. Het chronisch karakter van vele infecties wordt deels toegeschreven aan de kortstondige of schijnbare antibioticumtolerantie van een subset van langzaam profilerende bacteriën, zogenaamde persisters. Bijgevolg wensen we een beter inzicht te krijgen in het heterogene karakter van interacties tussen gastheer en pathogeen, en onderliggende mechanismen in kaart te ...
Riboproteogenomics van het sORF-gecodeerde Salmonellapeptidoom Universiteit Gent
Recente ontwikkelingen in het onderzoeksveld van ribosoomprofilering maakten de studie van eiwittranslatie op een genoomschaal mogelijk door middel van massieve parallelle sequentie analyse van ribosoom-beschermde boodschapper-RNA-fragmenten Wanneer ribosoomprofilering gecombineerd wordt met het immobiliseren van 70S ribosoom translatie-initiatie complexen in bacteriën, vergemakkelijkt dit de identificatie van kleine open leesramen op een ...
PROFETIE: Translationele controle in infectiebiologie: riboproteogenomics van bacteriële pathogenen Universiteit Gent
Mijn recente bevindingen onthulden vertaling van talloze voorheen niet-geïdentificeerde (kleine) open leeskaders en expressie van alternatieve N-terminale proteoforms bij het bestuderen van bacteriële vertaling. Dit voorstel is gericht op het ontrafelen van het repertoire van bacteriële pathogene proteoforms die worden gebruikt om een succesvolle infectie in een zoogdierlijke gastheercel tot stand te brengen. Hoewel diepe sequentiebepaling ...