Projecten
Gekozen filters:
Gekozen filters:
Functionele analyse van nieuwe stress-geĆÆnduceerde peptiden in Arabidopsis thaliana. KU Leuven
Peptiden spelen een belangrijke rol tijdens de afweerrespons en ontwikkeling van planten. Via bio-informatische analyses wordt het steeds duidelijker dat planten een groot aantal peptiden produceren. Slechts een klein deel hiervan werd echter functioneel gekarakteriseerd. Daarom werd binnen de CMPG-PFI groep een gecombineerde methode ontwikkeld waarbij een transcriptoom gebaseerde identificatie van potentieel nieuwe (a)biotisch stress ...
Groei en ontwikkeling van hogere planten (MARS). Universiteit Antwerpen
In dit netwerk willen we bestuderen hoe de wortel en de scheut elkaar beĆÆnvloeden en hoe deze interactie bijdraagt tot de ontwikkeling van de plant. Omdat zo'n geĆÆntegreerde aanpak de mogelijkheid geeft tot de identificatie van belangrijke componenten betrokken in de plantengroei, willen we deze kennis ook toepassen op het gewas maĆÆs.
Het ontrafelen van de biologische rol van nieuwe stress-geĆÆnduceerde peptiden (SIPs) in Arabidopsis thaliana. KU Leuven
Plantpeptiden beschikken over een brede functionele diversiteit, variƫrend van ontwikkeling, groei, vruchtbaarheid, veroudering, celdood, symbiotische interacties en stresstolerantie. Ze fungeren als belangrijke componenten van cel-tot-cel communicatie, interfereren met signaaltransductiewegen of vertonen antimicrobiƫle activiteit. Desalniettemin is het totaal aantal peptiden zwaar onderschat en verschillende types peptiden onderbelicht. De ...
Nieuwe generatie sequencing voor een grondige transcriptoom analyse van een tropische plant-schimmel interactie (NEGENTROP). KU Leuven
Dit NEGENTROP voorstel wil nieuwe informatie en een dieper inzicht verwerven in de interactie tussen banaan en de pathogene schimmel Mycosphaerella fijiensis, die een belangrijke bedreiging en struikelblok vormt voor zowel de Ecuadoriaanse export als de globale banaan gerelateerde industrie. Hoge doorvoer, nieuwe generatie (next-generation) sequencing zal momentopnamen van het gastheer transcriptoom opleveren op bepaalde tijstippen tijdens het ...
Variabele tandem herhalingen in regulatorische genen als bron van "evolueerbaarheid". KU Leuven
Tandem herhalingen zijn erg onstabiele DNA sequenties. Deze herhalingen komens soms ook voor in coderende regio's. In dit project gaan we na of en hoe variabele tandem herhalingen in genen die coderen voor rgeulatorische proteĆÆnen zoals transcriptiefactoren en chromatineregulatoren de activiteit van deze proteĆÆnen beĆÆnvloeden en zo mogelijk zorgen voor fenotypische variabiliteit en evolueerbaarheid. Vooreerst worden alle genen in het S. ...
Het doel van het project is de ontwikkeling van een dataintegratiemethode voor simultane module detectie en de novo motief identificatie. KU Leuven
Het doel van het project is de ontwikkeling van een dataintegratiemethode voor simultane module detectie en de novo motief identificatie. Hiertoe zullen we de expertise van de KUL-bioi in biclusteren van expressiedata combineren met de expertise van Prof. Navarro in het gebruik van efficient data structuren and 'approximate pattern matching'.
De relatie tussen bloei-inductiegenen en houtvorming in Arabidopsis en Populus. KU Leuven
De relatie tussen bloei-inductiegenen en houtvorming in Arabidopsis en Populus.