Titel Promotor Affiliaties "Korte inhoud" "FWO internationale samenwerking met Polen: Computationele methoden voor massaspectrometriedata met hoge resolutie en massale parallelle sequencing" "Dirk VALKENBORG" "Centrum voor Statistiek" "De huidige ontwikkelingen in high-throughput technieken voor life sciences hebben geresulteerd in steeds grotere hoeveelheden data. Dit heeft geleid tot een situatie waarin de interpretatie van gegevens en de formulering van hypotheses achterblijven bij het tempo waarin gegevens worden geproduceerd. Het voorgestelde project richt zich op massa-spectrometrie gebaseerde proteomica en massale parallelle sequencing die de expressie en fragmentatiepatronen van duizenden biomoleculen meten in een enkel experiment. De resulterende enorme datasets worden vaak op een suboptimale manier geanalyseerd. Als gevolg hiervan gaat waardevolle informatie verloren. Het is onze ambitie om statistische en dataminingtechnieken toe te passen die het mogelijk maken het probleem aan te pakken en nieuwe inzichten en hypothesen te verkrijgen. De algoritmen worden toegepast op gegevens uit velden zoals bijvoorbeeld proteomica, lipidomics of epigenomica gegenereerd door verschillende soorten biotechnologische instrumentatie. Om onze doelstellingen te bereiken, voeren wij theoretisch en toegepast onderzoek uit aan de Universiteit van Warschau (UW), de Technische Universiteit van Warschau (WUT) en de Universiteit Hasselt (UH). Het project concentreert zich op probleemgerelateerde problemen (werkpakketten) die gericht zijn op het oplossen van problemen met gegevensverwerking. De onderwerpen passen binnen het gezamenlijke onderzoek en de Ph.D. bijlesprogramma's bij HU, UW en WUT. De financiering is bedoeld om de samenwerking en de mobiliteit van onderzoekers uit te breiden." "Ontwerp van productiesites met betrekking tot betrouwbare en responsieve levertermijnen in de chemische batch industrie." "Trijntje Cornelissens" "Engineering Management" "In het verleden werd de design van productiesites voornamelijk gebaseerd op het optimaliseren van kapitaal- en operationele kosten. In het huidige supply chain landschap zijn responsieve levertijden en betrouwbare leveringen echter even belangrijke strategische objectieven.Het doel van dit project is om de indicatoren ""responsiviteit"" en ""betrouwbaarheid"" op te nemen in de mathematische modellen voor het strategisch design van chemische batch productieplants. Dergelijk strategisch designbepaalt zowel de plantconfiguratie (aantal en grootte van equipment), als de grootte van de productiebatches voor de verschillende producten én de optimale productieplanningsstrategie. Afhankelijk van de productieomgeving (make-to-order of make-to-stock), werkingsmodus (cyclisch of niet-cyclisch) en ontwerpopties (parallelle apparatuur, speciale en tijdelijke opslagtanks of parallelle productielijnen), zullen verschillende optimalisatiemodellen worden opgesteld. In eerste instantie zullen kleinere design modellen oplost worden met exacte mathematische programmeertechnieken. Voor problemen op ware grootte zullen efficiënte meta- en matheuristieken worden ontwikkeld. Tenslotte zal bepaald worden welk model best gebruikt wordt bij specifieke sector- of bedrijfsomstandigheden." "Optimalisatie van de nautische logistieke keten naar de haven van Antwerpen." "Kenneth Sörensen" "Antwerp Maritime Academy, Engineering Management" "Dit project wil de verschillende karakteristeken en behoefen van de scheepvaartrafek naar Antwerpen beter in kaart brengen. Data-analyse zal ons in staat stellen om de intensiteit van de trafek veel beter te voorspellen om zo beter zicht te hebben op de capaciteit die nodig is om de pieken en uitzonderlijke situates zo goed mogelijk op te vangen. Op deze manier willen we een beter en efciënter aanbod aan nautsche diensten creëren die beter is afgestemd op de vraag. Bovendien kunnen toekomstge investeringsbeslissingen dankzij verbeterd inzicht ook beter worden onderbouwd. De optmalisate van de efciënte en de capaciteit is sterk afankelijk van het serviceniveau dat men wil aanbieden aan de scheepvaart en zijn belangrijke strategische vragen voor het management van de ketenactoren. Zo wil men via data-analyse een meer diepgaande uitwerking van de trafekprognoses realiseren om zo tot een betere monitoring van de performante van de ketenwerking te komen door bijvoorbeeld de beschikbare sluiscapaciteit beter in te zeten en te ontlasten bij piekmomenten; de eventuele loodstekorten en de sleepbootcapaciteit in de haven van Antwerpen beter in kaart te brengen." "ELIXIR Infrastructuur voor Data en Services om Life-Sciences Onderzoek in Vlaanderen te versterken" "Immunologie & Infectie, Immunologie - Biochemie, Centrum voor Statistiek" "In de levenswetenschappen staat data centraal. Het steunt op het genereren, delen en het geïntegreerd analyseren van enorme hoeveelheden digitale data. Door de beschikbare data in levenswetenschappen te combineren, wordt nieuwe kennis gegenereerd. Dit zorgt voor een drastische transformatie van biologisch onderzoek. ELIXIR is een Europese onderzoeksinfrastructuur die internationale resources in levenswetenschappen samenbrengt tot een geïntegreerde infrastructuur die onderzoekers toelaat om data en expertise uit te wisselen alsook toegang verschaft tot geavanceerde software en computationele resources, over disciplines en nationale grenzen heen. De Belgische ELIXIR Node biedt een breed spectrum van services aan met een focus op menselijke genetica, proteïne en plant onderzoek alsook training en software tools om management en analyse van onderzoeksdata te vereenvoudigen. Ons doel is dat onderzoekers in Vlaanderen en België zich kunnen concentreren op hun wetenschappelijke probleemstelling in plaats van op technische details in verband met data, compatibiliteit en rekenkracht door het aanbieden van aangepaste oplossingen, geïntegreerd in een Europese infrastructuur." "Framework service contract OC/EFSA/GMO/2018/02-LOT1" "Liesbeth BRUCKERS" "Centrum voor Statistiek" "Om op de Europese markt te kunnen worden gebracht zijn GGO's onderworpen aan wettelijke voorschriften die een wetenschappelijke beoordeling eisen van de mogelijke risico's voor de gezondheid van mens of dier. Het is deels de verantwoordelijkheid van de EFSA om onafhankelijk, objectief en transparant wetenschappelijk advies te verstrekken met betrekking tot de veiligheid van GGO's. Het EFSA GGO-panel beschouwd zowel gegevens gegenereerd door de aanvragers tijdens de productontwikkeling, alsmede eventuele andere relevante wetenschappelijke informatie gepubliceerd in de wetenschappelijke literatuur. Om aanvragers bij de opstelling en presentatie van genetisch gemodificeerde (GG) installatie marktvergunningen te leiden en assisteren heeft het GGO-panel van EFSA een leidraad ontwikkeld voor de risicobeoordeling van GG installaties en daarvan afgeleide levensmiddelen en diervoeders (FF GD). Deze leidraad beschrijft principes, concepten, gegevenseisen en problemen die moeten worden overwogen bij het uitvoeren van de risicobeoordeling van genetisch gemodificeerde installaties en daarvan afgeleide levensmiddelen en diervoeders. In het bijzonder, heeft het EFSA GGO-panel intensief gewerkt om expliciete objectieve, transparante en geharmoniseerde richtsnoeren voor experimenteel ontwerp en analyse te ontwikkelen. Deze omvatten de vaststelling van minimumeisen, en het verstrekken van specifieke statistische methodologieën voor veldproeven zowel voor de vergelijkende veiligheidsbeoordeling van genetisch gemodificeerde installaties en daarvan afgeleide levensmiddelen en diervoeders nodig voor de risicobeoordeling van voedsel-en voederveiligheid (FF). Binnen dit project zal CenStat een goede feedback geven aan het EFSA panel over GGO's met betrekking tot de aanvraagdossiers." "Dosis-respons relaties genotoxiciteitsmerkers, humane biomonitoring" "Liesbeth BRUCKERS" "Milieubiologie, Centrum voor Statistiek" "Het doel van deze studieopdracht is om data van verschillende humane biomonitoring-studies te poolen. Op basis van het gepoolde gegevensbestand zullen dosis-response modellen voor genotoxiciteit merkers bestudeerd worden. Het poolen resulteert in een hogere statistische power, een bredere blootstellingsrange en meer variatie in leefstijl en omgevingsfactoren." "Algorithmes voor het bepalen van optimale routes van voertuigen in geautomatiseerde magazijnomgevingen." "Trijntje Cornelissens" "Engineering Management" "De operationele planning van vorkliften en automatische gestuurde voertuigen (AGV's) voor op- en aflaadactiviteiten in magazijnen, gebeurt vandaag meestal manueel of met behulp van eenvoudige heuristieken. Er is weinig onderzoek uitgevoerd naar het optimaal plannen van de routes van deze voertuigen. Nochtans is het plannen van routes in een magazijnomgeving, mathematisch gedeeltelijk gelijkaardig aan de rittenplanning van wegvoertuigen, waarvoor wel een rijke onderzoeksliteratuur bestaat die een brede waaier aan probleemvarianten beschrijft, alsook geavanceerde algoritmes om deze op te lossen. De innovatie van dit project zit in het feit dat dit een van de allereerste pogingen is om de raakpunten tussen beide onderzoeksdomeinen te bestuderen om aldus de state-of-the-art in de operationele planning binnen magazijnen te verbeteren. We richten ons op een specifiek rittenplanningsprobleem (het full-truckload pickup and delivery problem) dat nooit eerder binnen de context van een magazijn bestudeerd is, selecteren de beste algoritmes voor dit probleem uit de literatuur, en passen deze aan voor de specifieke vereisten en beperkingen van AGV's in een magazijnomgeving. We zijn de eerste om deze aanpak te gebruiken. Het beter oplossen van het resulterende probleem, dat we het transport request scheduling problem (TRSP) genoemd hebben, zal magazijnbeheerders en softwareontwikkelaars van Warehouse Management Systemen helpen om AGV-operaties op een succesvolle manier te plannen." "Identificatie van determinanten van antibiotica gebruik en verbetering van voorschrijfgedrag via innovatieve statistische methoden" "Marc AERTS" "Centrum voor Statistiek" "Antimicrobiële resistentie, gedefinieerd als de mogelijkheid van bacteriën om een behandeling met antibiotica te overleven, is een groot probleem voor de volksgezondheid. In een eerste deel van dit voorstel zal ik de impact van de Europese Antibioticadag (georganiseerd sinds 2008) op het antibioticagebruik bepalen. In een tweede deel zal ik de stabiliteit van statistische modellen voor analyse van hierarchische gegevens bestuderen. In het derde deel zal ik, gebruik maken van de meest stabiele techniek (uit deel 2), determinanten bepalen voor (ongepast) voorschrijven van antibiotica bij patiënten met acute hoest en voor het niet deelnemen aan online training door huisartsen." "Promovendus in bedrijfsstatistieken" "Ingrid Van Keilegom" "Onderzoeksgroep Operations Research and Statistics (hoofdwerkadres Leuven)" "Dit onderzoek zal zich richten op Accelerated Failure Time Mixture Cure-modellen voor netwerkgegevens" "Cofinanciering Loonkost Dieter Heylen bij Marie-Curie financiering 'ECODIS'" "Niel HENS" "Centrum voor Statistiek" "Biologische processen die leiden tot transmissie van ziektes tussen gastheersoorten vormen een belangrijk onderzoeksveld bij epidemiologen en ecologen. Co-pathogenen worden geacht een sterke invloed te hebben op de kans dat een pathogeen succesvol overgedragen wordt van zijn normale gastheersoort naar een nieuwe. Slechts weinig is geweten hoe de transmissiedynamieken verlopen bij co-infecties in wilde dieren, en hoe deze uiteindelijk kunnen leiden tot besmettingen van nieuwe gastheersoorten. Dieter Heylen zal tijdens zijn MSCA fellowship o.l.v. Niel Hens (Universiteit Hasselt), Bryan Grenfell en Jessica Metcalf (Princeton University), en André Dhondt (Cornell University) mathematische en theoretische modellen ontwikkelen om een conceptueel kader te ontwikkelen, zich baserende op empirische data (o.a. B. burgdorferi s.s. en M. gallisepticum bij Noordamerikaanse gastheren en vectoren) en bestaande literatuur. Zowel direct- als vector-overdraagbare ziektes worden in beschouwing genomen."