Systeembiologische analyse van niche adaptatie bij resistent en virulente Salmonella pathogenen.

Het doel van dit PhD-project is om het proces van niche adaptatie bij Salmonella te bestuderen vanuit een systeembiologisch perspectief. Momenteel wordt niche adaptatie vooral bestudeerd op het niveau van het genoom, met de focus op coderende genen. Dit doctoraat zal zich toespitsen op het transcriptoom, en meer bepaald op de integratie van beide niveaus. Finaal zullen de bevindingen gemodelleerd worden met machine-learning technieken, hetgeen ons zal toelaten niche adaptatie veel breder te bestuderen. De methodologie zal getest worden op een specifiek Salmonella serotype, genaamd Salmonella Concord, dat we als paradigma gebruiken voor het huidige probleem van bloedstroominfecties met multiresistente Salmonellae in Sub-Sahara Africa.

Trefwoorden:MICROBIOLOGIE, BIO-INFORMATICA

Disciplines:Scientific computing, Bio-informatica en computationele biologie, Microbiologie, Systeembiologie, Laboratoriumgeneeskunde, Maatschappelijke gezondheidszorg, Publieke medische diensten

Project type:Samenwerkingsproject