Suiker binding in de active-site van plant GH32 proteïnen.

Het structuur-functie onderzoek op de plant GH32 glycoside hydrolasen heeft al veel inzichten opgeleverd mbt tot de moleculaire determinanten die bepalend zijn voor de sterk variërende substraatspecificiteit binnen deze familie (invertasen, FEH 's en FT 's). Toch blijven een aantal zaken onopgelost. Met dit project proberen we deze hiaten verder op te vullen. Meer bepaald streven we de 3 volgende doelstellingen na: 1. De ontdekking dat sommige GH32 enzymen sucrose kunnen binden zonder het af te breken, is de basis voor de hypothese dat sommige van deze FEH enzymen van niet-fructan planten misschien kunnen fungeren als katalytisch defecte invertasen. Dit zijn mogelijks proteïnen die sucrose binden maar niet hydrolyseren, en mogelijk belangrijke regulatorische functies vervullen in planten. Misschien opereren deze defecte invertasen als sucrose sensoren, die specifiek tussenkomen tijdens sucrose-specifieke signaalprocessen. Tijdens dit project willen we de sucrose (en fructan) bindings- en afbraakcapaciteit in nauw verwante defecte en katalytisch actieve invertasen beter bestuderen. Daarenboven willen we de specifieke sucrose bindingsmodi in de 2 systemen achterhalen en uitzoeken welke aminozuren specifiek verantwoordelijk zijn voor de waargenomen verschillen. 2. We willen nog beter het verschil doorgronden tussen hydrolasen (water als acceptor) en transferasen (sucrose of fructanen als acceptor) binnen de familie GH32. Zo kunnen we op termijn superieure FTs ontwikkelen voor specifieke toepassingen. 3. Doorgronden van de verschillen in acceptor substraat specificiteit tussen FTs die een groot verschil tonen in de geproduceerde fructan ketenlengte.

Trefwoorden:Sugar binding, Proteins

Disciplines:Biochemie en metabolisme, Systeembiologie, Medische biochemie en metabolisme