Multi-omics analyse van single-cell drug responses in Glioblastoma

Glioblastoma (GBM) blijft de meest kwaadaardige hersentumor.
Ondanks intensieve behandeling lijken de huidige benaderingen
onvoldoende effectief om echte klinische voordelen te bieden. GBM
vertoont complexe genetische afwijkingen die tot uitgebreide inter- en
intratumorale heterogeniteit leiden. De aanwezigheid van
‘exceptional responders’ in veel mislukte clinical trials suggereert dat
GBM waarschijnlijk bestaat uit tientallen kleine subgroepen die
allemaal een andere therapie vereisen. Omdat deze functionele
heterogeniteit grotendeels onontgonnen blijft, beoogt dit project om
single-cell drug responsen bij GBM in kaart te brengen. Hiervoor,
zullen we controle- en behandelde tumorstalen vergelijken met
behulp van een combinatie van transcriptionele en eiwit-gebaseerde
single-cell technologieën. Zo zullen we niet alleen in staat zijn om
responsieve en resistente tumorcel (sub)populaties te definiëren, het
zal ons ook toelaten om potentiële biomarkers te selecteren. De
experimentele condities en biomarkers zullen eerst worden
geoptimaliseerd adhv een heterogene biobank van patient-derived
GBM-cellijnen. Vervolgens zullen we muismodellen van GBM
gebruiken om de ex vivo en in vivo responscapaciteiten op single-cel
niveau te correleren, en om deze kenmerken uiteindelijk te
analyseren in verse tumorstalen. Dit project zal zo het landschap aan
gevoeligheden voor therapie in GBM met ongeziene resolutie in kaart
brengen en een fundamentele stap vormen naar therapie op maat.