< Terug naar vorige pagina

Project

Micropeptiden als nieuwe klasse bio-actieve peptiden bij hogere eukaryoten.

Micropeptides een type niet --- --- klassieke biologisch actieve peptiden, vertaald van korte open leesramen (sORFs; <100 aminozuren). Door het ontbreken van een N --- terminal handtekening signalering peptide, worden ze onmiddellijk vrij in het cytoplasma na de vertaling. Recent werden dergelijke peptiden ontdekt in verschillende eukaryote organismen en interessanter de biologische functie van één van hen, de tarsal --- minder gen micropeptide, werd onthuld in Drosophila melanogaster. Het speelt een rol in de vroege ontwikkeling door het reguleren van de epidermale differentiatie. Bij zoogdieren dit type van bio --- actieve peptiden is nog niet ontdekt, maar een aantal aannames te versterken het idee dat deze zijn ook aanwezig in hogere eukaryoten. Het doel is om nieuwe micropeptides in Drosophila melanogaster en Mus musculus ontdekken. Dit project combineert zowel natte --- lab en theoretische (in silico) experimenten. Ribosoom profilering experimenten (recent beschreven NGS --- gebaseerde techniek ribosoom --- gevangen mRNA fragmenten te sequencen) de vertaalde mRNA helderen beide modelorganismen. Verder verschillende MS --- gebaseerd peptidomics strategieën zullen worden uitgevoerd poging om de ontdekking van de micropeptides uit de bovengenoemde NGS experiment bevestigen. Daarnaast zal een peptide predictiealgoritme worden ontworpen op basis van bekende en nieuwe micropeptide sequentiekenmerken en het behoud. Tenslotte zal de gevonden micropeptides getest op activiteit op een reeks verschillende cellijnen. Integratie van de hiervoor genoemde experimenten zal ongetwijfeld leiden tot de ontdekking van nieuwe micropeptides, op dezelfde manier als microRNA, een belangrijke, maar lange tijd over het hoofd gezien de klasse van bio --- actieve moleculen.

Datum:1 jan 2014  →  31 dec 2019
Trefwoorden:Micropeptiden
Disciplines:Andere ingenieurswetenschappen en technologie