Kartering van het lange niet-coderende RNA landschap in kanker: van gendefecten tot functies

Gedurende het laatste decennium is het steeds duidelijker geworden dat de humane genoom doordringend getranscribeerd, wat leidt tot de productie van duizenden niet-coderende RNA-transcripten. Een specifieke subgroep van kleine niet-coderende RNA's genaamd microRNAs zijn uitvoerig bestudeerd en blijken te zijn betrokken bij vrijwel elk aspect van de biologie van kanker. Daarentegen blijft een grotere (en meer recent ontdekte) klasse van lange niet-coderende RNA-moleculen (lncRNAs) nauwelijks onderzocht. Met dit projectvoorstel willen we lncRNAs betrokken bij verschillende kanker entiteiten te kunnen identificeren en te karakteriseren. Kandidaat tumor suppressor en oncogene lncRNAs worden gelokaliseerd door systematische lncRNA genkopieaantal en genexpressie in kankercellen cellulaire modelsystemen en primaire kankercellen. De specifieke functie van kandidaat kanker lncRNAs worden vervolgens onderzocht door middel van in vitro en in vivo experimenten lncRNA verstoring. LncRNAs met bewezen tumor onderdrukkende of oncogene eigenschappen worden gekenmerkt nader het specifieke doel de lncRNA interactoom en verbonden trajecten helderen. Een gerichte en gedetailleerde studie van lncRNAs bij kanker kunnen nieuwe inzichten in kankerbiologie verschaffen en leveren aantrekkelijke targets voor therapeutische interventie.