Moleculaire en epidemiologische karakterisering van het Afrikaanse varkenspestvirus in Kameroen

HET NIEUWSTE VAN HET NIEUWSTE Kameroen is een lager-inkomensland met een bevolking van 23,4 miljoen inwoners in 2016, waarvan 43,5% onder de nationale armoedegrens leeft (inkomen minder dan 3,1 USD / dag / inwoner). Naar schatting leeft 24% van de bevolking onder de internationale armoedegrens (inkomen van 1,9 dollar / dag / hoofd van de bevolking). De landbouwsector draagt 20% van het bruto binnenlands product (BBP) van Kameroen bij, waarbij de veehouderij 13% bijdraagt en 30% van de plattelandsbevolking tewerkstelt. In Kameroen is een derde van de huishoudens betrokken bij de veeteelt. 23,3% van deze veehouderijhuishoudens boeren varkens. Vee biedt deze gezinnen inkomsten en voeding. De huidige varkensproductie wordt geschat op 2,02 kg / persoon en is aanzienlijk lager in vergelijking met de verwachte 5 kg / persoon. Hoewel Kameroen de op drie na grootste producent van varkensvlees is in Afrika, bereikt het zijn maximale capaciteit niet omdat de sector te maken heeft met talrijke dierziekten, waarvan Afrikaanse varkenskoorts (ASF) van het allergrootste belang is. De eerste ASF-uitbraak vond plaats in 1982 en trof meer dan 80% van de 1,6 miljoen varkens in Kameroen. Sinds 1982 waren er talrijke uitbraken, met de meest recente in 2017, waarbij het zuidwesten en het noorden van het land werden getroffen. Het ASF-virus (ASFV) is een dubbelstrengig DNA-virus van de familie Asfaviridae, geslacht Asfivirus. Het veroorzaakt dodelijke hemorragische koorts bij tamme varkens; terwijl wrattenzwijnen en struikvarkens asymptomatisch blijven. ASFV wordt overgedragen door geleedpotigenvectoren van het zachte teekgenus Ornithodoros onder andere transmissiewijzen. Het virion heeft een icosahedrale symmetrie met een gemiddelde diameter van 200 nm. Het virion bestaat uit een nucleoprotinekern omgeven door een binnenste omhulling, een buitenste capsidelaag en een buitenste omhulling. De lineaire virale genomen codeert voor ~ 160 genen die worden vertaald in meer dan 50 eiwitten. ASFV richt zich voornamelijk op immuuncellen van de myeloïde lijn, vooral monocyten en macrofagen, waarvan wordt gedacht dat ze cruciaal zijn voor persistentie en verspreiding van virussen. Struikvarkens en wrattenzwijnen zijn natuurlijke reservoirgastheren van Afrikaanse varkenspestvirussen, die geen klinische ziekteverschijnselen vertonen wanneer ze zijn geïnfecteerd met dezelfde zeer virulente isolaten van ASFV die snelle, hemorragische sterfte veroorzaken bij tamme varkens. Tot op heden zijn er geen commercieel verkrijgbare vaccins of antivirale middelen voor Afrikaanse varkenspest (ASF). Hoewel een aantal experimentele, levende verzwakte vaccins veelbelovend zijn, b.v. BA71ΔCD2. De huidige vooruitzichten voor de ontwikkeling van een vaccin zijn goed, omdat varkens die de ziekte hebben overleefd, weerstand kunnen bieden aan uitdagingen door verwante virulente virussen. Jammer genoeg zijn geïnactiveerde ASF-virionen niet voldoende om een beschermende immuunrespons te induceren, noch induceren ze neutraliserende antilichamen. Het is niet verrassend dat met zoveel ASF-uitbraken die sinds 1982 in Kameroen zijn ervaren, het genetische en serologische verschil van geïsoleerd ASF-virus substantieel is. Daarom worden ze per jaar van isolatie genoemd als CAM82, CAM 85, CAM 87, CAM87 en CAM88. De huidige circulerende stam moet nog worden gekarakteriseerd. Genetische heterogeniteit en diversificatie zijn belangrijke uitdagingen voor ziektepreventie door vaccinatie vanwege de selectie van mutanten die niet significant worden beïnvloed door de vaccin-geïnduceerde immuunrespons. Een interessante benadering voor de behandeling / preventie van ASFV kan betrekking hebben op op gastheer gerichte immunomodulerende therapieën. Deze strategie is gericht op het exploiteren van natuurlijke mechanismen in de gastheer voor het initiëren of versterken van beschermende antimicrobiële immuniteit terwijl het door ontsteking geïnduceerde weefselschade wordt beperkt. Met tal van uitbraken van ASFV in Afrika en vele andere landen zoals Polen, Rusland, Oekraïne, Moldavië en de Tsjechische Republiek in 2017 dreigt Kameroen op het punt van een nieuwe uitbraak als niets wordt gedaan. Zo blijft ASF een voortdurende bedreiging voor zowel Kameroen als de rest van de wereld. De epidemiologische situatie van ASF in het land wordt sterk onderschat vanwege de vele factoren die hier van invloed zijn. Bijvoorbeeld: (i) beperkte opleiding en gebrek aan opleiding voor veehouders, (ii) zwakke adviesdiensten die de toegang tot innovatieve technieken door boeren belemmeren, (iii) lage capaciteit voor laboratoria voor diagnose. Er wordt zeer weinig onderzoek gedaan op het niveau van Kameroen voor de uitroeiing van het ASF-virus en het opstellen van profylactische strategieën ondanks de inspanningen van de regering om de ziekte onder controle te houden. 

ALGEMENE DOELSTELLINGEN Het doel van dit project is het onderzoeken van de epidemiologie en moleculaire karakterisering van AVP-isolaten en SLA klasse I diversiteit van AVP-gevoelige en tolerante varkensrassen in Kameroen. Over het algemeen zijn er drie hoofdcycli voor de verspreiding van de AVP in Afrika bekend, maar in Kameroen is tot nu toe bewezen dat er slechts één enkele cyclus bestaat op basis van onderzoek dat in 1985 is uitgevoerd. Evenzo zijn de inheemse varkens in Kameroen tolerant voor de ASFV maar de exotische rassen niet. In dit project willen we de belangrijkste routes voor de verspreiding van de AVP in Kameroen bepalen op basis waarvan de autoriteiten passende controlemaatregelen zullen nemen om de ziekte te helpen bestrijden. We zullen ook de isolaten uit Kameroen moleculair karakteriseren, wat in de toekomst zal helpen bij het bepalen van de oorsprong van toekomstige uitbraakstammen als deze anders zijn dan de reeds aanwezige in het land. Ten slotte zullen we de MHC van varkens vergelijken binnen de tolerante (lokaal en kruisingen tussen lokaal en exotisch) en vatbare (lokaal en exotisch) rassen met als doel te onderzoeken op bewijs van positieve selectie en heterogeniteit. De resultaten van deze studie zullen beleidsmakers in het land en het ministerie van veeteelt enorm helpen bij het ontwikkelen en opvolgen van alle belanghebbenden in de varkensindustrie, met als doel de AVP in Kameroen te verminderen en uit te roeien.