< Terug naar vorige pagina
Project
Impact van auxinesignalisatie op wortelkolonisatie van Arabidopsis thaliana door Azospirillum brasilense.
Plantengroeibevorderende rhizobacteriën (PGPR) kunnen de groei en ontwikkeling van planten rechtstreeks of onrechtstreeks beïnvloeden. Het best gekende voorbeeld van rechtstreekse plantengroeibevordering is de bacteriële synthese van plantenhormonen. De synthese van auxinen in de rhizosfeer, met indool-3-azijnzuur (IAA) als kwantitatief belangrijkste auxine, leidt tot stimulatie van de vorming van laterale wortels en wortelhaartjes. Recent onderzoek bracht een geheel nieuw aspect van auxinesignalisatie in planten aan het licht. Auxinesignalisatie maakt deel uit van het aangeboren immuunsysteem van Arabidopsis, en wordt onderdrukt bij infectie door fytopathogenen. Deze fytopathogenen kunnen interfereren met de auxinesignalisatie als strategie om het basale verdedigingsmechanisme van de plant te doorbreken. Deze bevindingen zijn zeer relevant voor de studie van bacteriële plantengroeibevordering, gezien ook heel wat rhizobacteriën, zoals Azospirillum, in staat zijn auxine te produceren. De vraag stelt zich dus in welke mate en op welke wijze de bacteriële auxineproductie betrokken is in het wortelkolonisatieproces. De algemene doelstelling van het project is een kwantitatieve en kwalitatieve analyse van wortelkolonisatie van Arabidopsis thaliana door Azospirillum, met nadruk op de rol van bacteriële auxineproductie.
De algemene doelstelling bevat twee specifieke doelstellingen. De eerste specifieke doelstelling is het in kaart brengen van de differentiële genexpressie in Arabidopsis als gevolg van wortelkolonisatie door Azospirillum wild-type en mutanten gewijzigd in IAA synthese en celoppervlak. Dit zal leiden tot identificatie van Arabidopsis genen en pathways waarvan de expressie wijzigt als gevolg van kolonisatie. In de tweede doelstelling wordt de rol van Azospirillum oppervlaktestructuren en auxinesynthese in de kolonisatie van Arabidopsis nagegaan, gebruikmakend van Arabidopsis mutanten. Dit zal een beter beeld geven van hoe de geïdentificeerde Arabidopsis genen en pathways het kolonisatieproces kwantitatief en kwalitatief beïnvloeden. De resultaten zijn bruikbaar voor de verdere ontwikkeling van bacteriële inocula voor plantproductie en als input voor veredelingsprogrammas.
De algemene doelstelling bevat twee specifieke doelstellingen. De eerste specifieke doelstelling is het in kaart brengen van de differentiële genexpressie in Arabidopsis als gevolg van wortelkolonisatie door Azospirillum wild-type en mutanten gewijzigd in IAA synthese en celoppervlak. Dit zal leiden tot identificatie van Arabidopsis genen en pathways waarvan de expressie wijzigt als gevolg van kolonisatie. In de tweede doelstelling wordt de rol van Azospirillum oppervlaktestructuren en auxinesynthese in de kolonisatie van Arabidopsis nagegaan, gebruikmakend van Arabidopsis mutanten. Dit zal een beter beeld geven van hoe de geïdentificeerde Arabidopsis genen en pathways het kolonisatieproces kwantitatief en kwalitatief beïnvloeden. De resultaten zijn bruikbaar voor de verdere ontwikkeling van bacteriële inocula voor plantproductie en als input voor veredelingsprogrammas.
Datum:1 jan 2009 → 15 sep 2013
Trefwoorden:root development, colonization, microarray, PGPR, auxin signaling, Azospirillum
Disciplines:Plantenbiologie
Project type:PhD project