Identificatie van nieuwe genen, oorzakelijk voor syndromatische vormen van microcefalie, met behulp van genoomwijde benaderingen

Microcefalie is een conditie waarbij de hersenen geen normale groei vertonen. Deze conditie kan veroorzaakt worden door genetische en niet-genetische factoren en is vaak een kenmerk van een breder syndroom. De genendie aan de oorzaak liggen van syndromatische microcefalie zijn grotendeels onbekend, maar er is evidentie dat genen betrokken in de regulering van de celcyclus een belangrijke rol spelen. Op basis van het succesvol identificeren van genen die de celcyclus beïnvloeden in syndromatische microcefalie, de expertise en de grote beschikbaarheid van patiënten met ontwikkelingsstoornissen, en een groot aantal kandidaat loci voor microcefalie, geïdentificeerd door de genoomwijde 'copy number variation screen', stellen we een meervoudige benadering voor voor het ontdekken van nieuwe causale genen. In de eerste plaats zullen we systematisch cellijnengenereren en screenen voor defecten in de celcyclus. In geselecteerde cellijnen zal het expressieprofiel worden bepaald. Ten tweede willen we genen identificeren die dominante en recessieve vormen van microcefalie veroorzaken. De dominante vormen zullen geïdentificeerd worden door overlappende de novo 'copy number variations' te identificeren en de recessieve door het doelgericht 'resequencen' van geselecteerde CNV regio's. De nieuwe kandidaatgenen geïdentificeerd via deze 'screens' zullen worden 'geresequenced' in 500 patiënten met syndromatische microcefalie. We voorzien dat deze benadering verschillende nieuwe causale genen voor microcefalie zal identificeren.

Trefwoorden:Next-generation sequencing, CNV's, Cell cycle, Microcephaly

Disciplines:Medische beeldvorming en therapie, Andere paramedische wetenschappen, Genetica, Systeembiologie, Moleculaire en celbiologie

Project type:PhD project